基于重症肌无力miRNA-mRNA双重表达谱解析miRNA调控通路的研究

Myasthenia gravis (MG) is an autoimmune disease caused by impaired transmission at the neuromuscular junction. It's a great challenge for us to analyze the molecular pathogenesis of MG basing on miRNA-mRNA double gene expression profile,which is caused by MG abnormal regulatory pathways of miRNAs and their targetgene sites. This subject obtain thymus specific miRNA-mRNA double gene expression profile of MG using the next-generation sequencing technology. Identifing the differential expression of miRNAs and their targetgenes,and confirming MG thymus specific maladjusted pairs of miRNA-mRNAs using miRNAs targetgenes data base(miRanda,et al),then finding the MG-related biological pathways which are regulated by miRNA using data base(KEGG，et al).We construct regulatory network of MG miRNA-pathway and dig the key miRNA regulatory pathways,miRNAs and their targetgenes of MG. Finaly,we validate it with biological experiments. we will analyze the molecular mechanisms of MG in the level in system of miRNAs and miRNA target sites and their pathways,then clarify the pathogenesis and molecular diagnosis and treatment of MG.Also, it holds promise for the drug development and individual treatment of MG.

重症肌无力(MG)是神经-肌肉接头传递功能障碍的获得性自身免疫疾病。基于MG的miRNA-mRNA双重表达谱解析miRNA与靶基因及其异常调控通路所致MG发病的分子机制是一个巨大挑战。本课题采用新一代测序技术获得MG胸腺特异性miRNA、mRNA双重表达谱,识别miRNA与靶基因差异表达，结合 miRNA靶基因数据库(miRanda,et al),确定MG胸腺特异性miRNA-mRNA失调对,利用生物学通路数据库(KEGG,et al)识别MG相关 miRNA调控的生物学通路，构建MG的miRNA-pathway调控网络,并挖掘MG关键的miRNA调控的pathway、关键miRNA及其靶基因，采用生物学实验进行验证。课题研究成果将从系统水平上解析miRNA与靶基因及miRNA调控的pathway在MG发生发展中的作用，为阐明MG的致病机理及分子诊治和个体化治疗提供重要的依据。

重症肌无力(MG)是神经-肌肉接头传递功能障碍的获得性自身免疫疾病。基于MG的miRNA-mRNA双重表达谱解析miRNA与靶基因及其异常调控通路所致MG发病的分子机制是一个巨大挑战。本课题采用新一代测序技术获得MG特异性miRNA、mRNA双重表达谱，识别miRNA与靶基因差异表达，结合miRNA靶基因数据库(miRanda,et al),确定MG特异性miRNA-mRNA失调对，利用生物学通路数据库(KEGG,et al)识别MG相关 miRNA调控的生物学通路，构建MG的miRNA-pathway调控网络，并挖掘MG关键的miRNA调控的pathway、关键miRNA及其靶基因。我们发现MG相关的失调通路存在显著的交流互作，通路的互作是通过MG相关的miRNA调控基因介导的。最终采用生物学实验在MG患者中进行验证。此外，我们通过人工注释和文本挖掘的方法开发了神经系统疾病相关的非编码RNA数据库平台NSDNA (访问网址：http://www.bio-bigdata.com/nsdna/)，用于管理和储存神经系统疾病包括MG相关的ncRNA数据。NSDNA数据库包括浏览、查询、提交、下载和优化数据的功能。NSDNA平台自2017年1月正式发表以来，访问量已经超过2000次，40个国家的研究者进行访问。这说明我们开发的平台得到了国内外科研人员的广泛使用和关注。课题研究成果从系统水平上解析miRNA与靶基因及miRNA调控的pathway在MG发生发展中的作用，为阐明MG的致病机理及分子诊治和个体化治疗提供重要的依据。