红树林小单胞菌培养与非培养水平多样性与地理分布

小单胞菌是药用海洋放线菌研究的热点，近几年报道了许多新的属、种及其新生物活性天然产物。本项目将采集我国红树林地区的土壤样品，设计小单胞菌科特异引物，在非培养水平进行16S rRNA基因克隆文库分析，在培养水平对小单胞菌科不同属进行选择性分离和快速鉴定，并应用统计软件分析土壤样品的理化变量与样品中培养与非培养水平的小单胞菌科类群的关系，从而认识我国红树林小单胞菌科的类群、分布及与土壤理化变量的关系，为理性地收集红树林小单胞菌资源奠定基础。

本项目采集了海南文昌、海南三亚、广东湛江、广西北海4个不同红树林区16个样点的土壤样品。设计了小单胞菌科特异引物，在非培养水平进行了16S rRNA基因克隆文库分析，在培养水平对小单胞菌科不同属进行选择性分离和快速鉴定，并应用统计软件分析土壤样品的理化变量与样品中培养与非培养水平的小单胞菌科类群的关系。结果表明红树林地区在非培养水平有10个属，Micromonospora，Rugosimonospora，Plantactinospora和 Verrucosispora等4个属在4个红树林地区均有分布。某一特定的红树林土壤样品，只有少数 OTUs的丰度较高，大部分的基因型的丰度都很低，存在优势种群，分类水平越低，地理分布越明显。并且，红树林土壤中的小单孢菌种群与环境因子没有相关性。培养方法分离获得了300株小单胞菌，其中鉴定小单孢菌新种7个，小单孢菌科疣孢菌新种1个。并从一株小单孢菌科继生菌新属中获得了抗病毒活性天然产物。