近交系小鼠遗传检测的单碱基延伸标签反应基因芯片研究

In this study, we will construct a method to gentype 48 SNPs of 30 inbreed mouse with the improved single base extension(SBE) microarray . with this technology, 48 inbreed mouse could be genetic monitored by several times PCR, several times SBE , and one time chip hybridization. the precise, rapid, high-throughput, low cost and other advantages has important significance to enhance mouse genetic monitoring efficiency.

本课题拟以改良的单碱基延伸标签反应基因芯片技术与多重PCR技术相结合，通过几次PCR、几次单碱基延伸、一次芯片杂交就能同时对小鼠的48个的SNP位点进行同时分型，达到对48个近交系小鼠品系进行遗传检测的目的，具有准确、快速、高通量、低成本等优点，这对于提高大小鼠的遗传检测效率具有重要意义。

实验动物的遗传质量稳定性是科学研究实验结果的可靠性、稳定性及可重复性的重要保证，而定期对实验动物进行遗传检测是为了证实各品系动物应具有的遗传特性，检查是否发生遗传突变和遗传污染等，以确保被检对象符合该品系的要求，而国内目前主要还是使用生化标记进行遗传测，本课题采集了国内现有的48个品系的近交系小鼠，选取对性状有影响的非同义突变的SNP位点，分别建立了质谱法、微流控芯片法、SNPline法的小鼠SNP分型技术，不仅对国内的近交系小鼠的遗传概貌进行了分析，同时建立了三种不同的近交系SNP小鼠遗传检测方法。同时本课题还建立了能同时检测大小鼠7种细菌的微流控芯片技术，大大节省大小细菌检测的时间。本课题还对两家国家种子中心的最常用的C57/B6J小鼠进行全基因组测序，比较分析了不同单位的C57/B6J小鼠的遗传差异，为科研人员在选择小鼠及相关分析提供了数据依据。