细菌基因组DNA磷硫酰化修饰的位点选择及其机理研究

细菌DNA磷硫酰化修饰是首次发现的DNA磷酸骨架上的生理修饰。项目拟对含有DNA硫化修饰的E.coli B7A、Streptomyces lividans 1326、Streptomyces avermitilis、Salmonella enterica serovar Cerro isolates 87及Pseudomonas fluorescens PfO-1五个菌株的基因组具体修饰位点进行大规模鉴定。通过物种内修饰位点的DNA序列比对，求出修饰发生的保守顺序。利用已知的基因组序列对发生修饰的位点进行定位，统计修饰发生在基因间或基因内的比例，探索DNA硫化修饰的基因组位置规律性。通过体内遗传学和体外DNA-蛋白相互作用实验，确定相关Dnd蛋白的序列选择功能，为透彻阐明细菌磷硫酰化的生理意义奠定基础。