基于探针杂交机制的生物芯片数据预处理统计方法研究

本项目研究跨实验室、跨平台芯片数据预处理与整合问题。旨在发展一套基于芯片探针杂交物理模型的统计方法，考虑到芯片中探针强度对探针序列的相关性以及PCR扩增所带来的系统偏差，利用单芯片样本估计靶序列拷贝数，实现跨实验室、跨平台芯片数据标准化与整合。作为应用，拟将算法应用于多种芯片数据分析之中，分析包括基因表达芯片、SNP芯片、Tiling Array芯片以及外显子芯片(Exon Array)等流行的生物芯片数据，开发多种芯片数据预处理开源软件，为生物学家提供分析工具。