霍乱弧菌超级整合子的微进化及对霍乱弧菌环境适应性作用的研究

细菌整合子对基因尤其是耐药基因在菌间水平传递发挥重要作用，霍乱弧菌携带二百多个基因的超级整合子（SI），不仅仅携带耐药基因，而且大多数基因功能未明。我们对流行以及非致病菌株的比较基因组杂交以及国外初步的研究，发现除去SI的基因组非常稳定，SI的变异极大的影响了霍乱弧菌整体稳定性分析。为研究霍乱弧菌SI微进化和其在霍乱弧菌环境适应中的作用，本研究中，我们拟采用PCR扫描分析不同霍乱流行时期的霍乱弧菌优势血清群/型菌株以及环境分离非产毒株SI的变异，绘制实验菌株的扫描图谱，测定SI中相比较于全测序霍乱菌株的新插入基因；利用基因整合缺失模型比较霍乱弧菌内不同类型整合酶整合、缺失基因盒的能力；分析在不同环境因素包括氧变化、pH、胆盐浓度、温度以及兔肠段内的SI区不同基因转录变化，以研究霍乱弧菌SI在不同菌群间的基因和序列变异与产毒株进化的关联、以及SI基因组成变异与霍乱弧菌环境变化适应性的关系。