中国大陆2a型丙型肝炎病毒基因组的一级结构及其变异

以逆转录套式聚合酶链反应分段重叠扩增、克隆中国大陆2a型丙型肝炎病毒全基因序列、核苷酸序列分析显示其cDNA的一级结构，全长共9401bp，发现在全基因核苷酸水平，中国大陆2a型HCV与日本株HC-J6的同源性非常高，达93.14%，各个基因区比较差异有所不同，在非结构基因5b区发现一个新的3个核苷酸的缺失突变和一个读码框架内的移码突变所引起的终止突变，在非结构基因5a区有一段长36bp的与干扰素诱导免疫压力有关的缺失突变，明确2a型HCV中国株核苷酸的保守位点，2a型内不同毒株间的核苷酸同源性低于1b型内不同毒株间的同源性。所有序列已在美国基因库登录。以此研究为基础的后续的丙型肝炎病毒复制的研究进展顺利。