microRNA功能相似度度量的生物信息学方法研究

通过生物信息学方法度量microRNA（miRNA）之间的功能相似度可以快速预测miRNA的功能和可能参与的疾病，是快速认识miRNA的重要研究手段。但是，因为大多数miRNA的功能未知，因此，目前还没有专门的生物信息学方法用于该目的。我们整理注释了大量的miRNA和疾病关联数据，并研究发现miRNA的功能和其所参与的疾病具有密切关联，并且疾病之间的关系可以用树状结构定量描述。根据以上观察，我们提出基于miRNA和疾病关联数据的miRNA功能相似度生物信息学度量方法，旨在通过度量miRNA所关联疾病的相似度来度量miRNA的功能相似度。该项目的完成将不仅很大程度上解决miRNA功能相似度的生物信息学度量这一科学问题，而且为快速注释miRNA功能、预测miRNA相关疾病、鉴定新的疾病生物标记物提供了一种新方法。因此，本项目的完成既具有一定的理论意义，又具有实际的应用价值。

在本自然科学基金青年项目的资助下，本人系统研究了基于microRNA（miRNA）和人类疾病关联数据的miRNA功能相似度度量的生物信息学方法，并实现了相应算法。系统研究人类基因间长链非编码RNA（lncRNA）上单核苷酸多态性（SNP）。构建了国际上第一个长链非编码RNA疾病数据库（lncRNADisease），并开发了一个基于lncRNA基因组位置的lncRNA相关疾病预测生物信息学方法。受本基金资助，本人发表SCI论文2篇，本人所在课题组发表SCI论文1篇。