LncRNA FENDRR在非小细胞肺癌转移中的作用和机制研究

Non-small-cell lung cancer (NSCLC) is one of the most common malignant tumors in the world, metastasis is the main cause of death in lung cancer patients. Studies show that expression of lots of lncRNAs changed in cancer, and is closely associated with cancer progression. However the precise regulation mechanism of lncRNAs on cancer metastasis is still unclear.. We use weakly invasive and highly invasive cell line as study subjects, then take advantage of human genome expression array and Bioinformatics, combining expression and function verification, eventually identify FENDRR as study interest. Meanwhile, literatures showe that the role of LncRNA FENDRR in the metastasis of lung cancer remains unclear. Our preliminary studies indicates that, compared to weakly invasive cell line, highly invasive cell line has much lower expression of FENDRR, which correlates with clinical lung cancer metastasis. We will explore the molecular mechanism of FENDRR inhibiting metastasis of NSCLC by RNA pull down, RNA sequencing, proteomic analysis and RIP etc., This study may provide theoretical guidance and experimental basis for effective treatment of NSCLC.

非小细胞肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，转移是导致非小细胞肺癌患者死亡的主要原因。研究发现长链非编码RNAs（LncRNAs）与癌症发生密切相关。然而LncRNAs对癌症转移的具体调控机制尚不明确。. 本项目以肺癌高低转移细胞系为研究对象，利用人全基因组表达谱芯片及生物信息学分析，结合表达和功能验证实验，初步确定LncRNA FENDRR为研究对象。同时，文献表明FENDRR在肺癌转移中的作用及机制迄今未见报道。我们的前期研究发现，与低转移细胞系相比，高转移细胞系中FENDRR低表达且与临床肺癌转移相关；体外过表达FENDRR可抑制肺癌细胞的增殖和迁移能力；我们将从分子、细胞、动物模型及临床标本等层面，采用RNA pull down、RNA测序、RIP及蛋白质谱分析等方法探究FENDRR抑制非小细胞肺癌转移的分子机制，以期为非小细胞肺癌的治疗提供理论指导和实验依据。

长非编码RNA（lncRNA）在包括肺癌在内的许多癌症类型的发生和发展中起着关键作用。这项研究的目的是研究与非小细胞肺癌（NSCLC）相关关的lncRNA的功能和分子机制。首先，我们从2个基因组数据集中筛选了7个与肺癌相关的差异表达LncRNA。在这些lncRNA中，FOXF1相邻非编码发育调控RNA（FENDRR）是唯一一个在晚期病理患者中显著下调且与预后呈负相关的基因。因此，该项目进一步研究了lncRNA FENDRR。我们进一步分析了GSE30219数据集以及我们实验室中存储的73对肺癌和非癌组织中FENDRR的临床相关性；随后，我们使用系统发生密码子替代频率（PhyloCSF）工具，编码潜力评估工具（CPAT）和编码潜力计算器（CPC）在线分析工具评估了FENDRR编码潜力。核质分离实验检测FENDRR在细胞中的分布；通过CCK8和克隆形成实验来检测细胞生长能力，使用Transwell迁移和侵袭实验来检测转移能力。机制上，我们通过利用癌症基因组图谱（TCGA）数据分析了NSCLC中FENDRR功能与免疫反应的相关性。结果表明FENDRR呈临床负相关性。编码潜力分析显示FENDRR为非编码RNA。 FENDRR的表达升高可导致细胞生长停滞，体外增殖能力受到抑制，NSCLC细胞迁移和侵袭能力下降。从机制上讲，我们发现FENDRR表达可能与异常的免疫反应调节有关。综上所述，我们的研究结果提示lncRNA FENDRR可能通过调控肿瘤免疫反应抑制NSCLC发展。