lncRNA应用于环境毒理学的探索研究

Long non-coding RNA(lncRNA) plays an important role in cell signaling transduction and physiological processes. Organic pollutants change the genes expression and induce the toxicity via manipulating lncRNA epigenetically. This project is including: 1. Study on the transcriptional changes of lncRNA-HOTAIR after exposure to frequently used xeno-estrogens(alkyl phenols, plasticizers, estrogen drugs) in breast cancer cells MCF-7; Investigate the response concentrations and exposure times; Establish the lncRNA biomarkers of estrogenic effects in vitro. 2. Study on the effects of silence or over expression of HOTAIR on cell proliferation, apoptosis, migration or invasion assays in MCF-7 cells. 3. Base on next-generation sequencing results and lncRNA datebase of zebrafish, estrogen-sensitive lncRNAs will be screened in zebrafish larvae, and the molecular function of these lncRNAs will be studied further.

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)在细胞信号传递和生理过程中有重要作用。有机污染物可在表观遗传水平调控lncRNA，从而调节基因表达变化并诱导毒性效应。研究内容为：一、研究不同类型环境雌激素(烷机酚、塑化剂和雌激素药物等)暴露乳腺癌细胞MCF-7后，目标lncRNA-HOTAIR转录水平的变化和规律。确定响应浓度和暴露窗口期，在离体模型中建立雌激素效应的lncRNA生物标志物。二、在乳腺癌细胞中过表达或沉默lncRNA-HOTAIR，通过细胞增殖、凋亡、迁移或侵袭等功能学实验，研究其在环境雌激素调控下的功能。三、环境雌激素暴露斑马鱼幼鱼，利用二代测序技术筛选对环境雌激素敏感的lncRNA, 通过比较斑马鱼lncRNA数据库，初步研究敏感lncRNA的相关功能。

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)在细胞信号传递和生理过程中有重要作用。环境污染物可在表观遗传水平调控lncRNA，从而调节基因表达变化并诱导毒性效应。在本研究中，我们旨在研究与汞暴露相关的lncRNA特异表达，并在斑马鱼胚胎中鉴定表观遗传生物标志物。我们检测了斑马鱼胚胎在暴露于汞化合物和其他四种重金属后，其中5个神经系统有关的lncRNAs (birc6-as2, mettl3, malat1, stedlb1a和oip5-as)的转录水平，以识别特异性敏感的lncRNA。利用原位杂交分析，我们研究了斑马鱼胚胎在汞化合物暴露后lncRNA-malat1的时空表达模式。随后，我们利用生物信息学的方法对lncRNA-malat1进行分析。最后，研究汞暴露后，对斑马鱼幼鱼运动行为和神经基因的表达进行了检测，以揭示在汞暴露后，lncRNA-malat1参与神经毒性过程和作用。本研究揭示了汞化合物暴露中lncRNA的调节变化，发现malat1可以成为潜在的生物标志物，并对表观水平lncRNA在重金属化合物毒性中的作用进行初步探索。