原发性肝癌蛋白质相互作用网络构建方法研究

本研究以原发性肝癌为切入点，探讨肝癌细胞蛋白质相互作用网络。利用前期已建立的肝癌患者资料信息库，获取肝癌细胞蛋白质表达数据资料，构建可供计算分析的肝癌细胞蛋白质互作数据库。以公共数据库DIP（Database of Interacting Proteins）提供的人类蛋白质互作数据为验证集，改进关联规则数据挖掘方法，寻找蛋白质间可能存在的互作规则。在得到的规则基础上，采用贝叶斯网络学习方法，同DIP中已知的蛋白质相互作用对比，以提高贝叶斯网络的覆盖能力为评价条件，优化网络参数的估计方法，建立能够构建具有概率意义，且符合生物学特征的蛋白质互作网络的方法。将关联规则-贝叶斯网络学习方法应用于肝癌细胞蛋白质互作数据库，构建具有较好预测能力的肝癌蛋白质互作网络模型。依据所建立的模型探索肝癌细胞已知蛋白质的新功能和未知蛋白质的功能，探讨肝癌细胞蛋白质相互作用的生物学意义，为疾病的临床研究提供参考。