蛋白质核酸适配体高效筛选的毛细管电泳方法学基础研究

蛋白质的核酸适配体在生物分析和传感、疾病诊断和治疗方面具有广阔的应用前景。目前限制其应用的瓶颈问题是缺乏普适性的筛选方法，筛选效率低。要从大容量的核酸库中快速筛选出极少量的适配体分子，需深入了解靶蛋白与核酸库的特性及二者的匹配度，研究靶蛋白在核酸分子混合库中与适配体特异性结合的机理和影响因素以及不同性质靶蛋白在核酸库中结合适配体的规律，优化核酸库的合成设计，减少筛选的盲目性，提高筛选效率。本课题基于上述思考提出新的思路：利用毛细管电泳的特色和优势，建立靶蛋白与核酸库作用的表征评价方法，建立靶蛋白与核酸库的"匹配度"概念和定值方法，建立筛选前的预判方法，指导核酸库的选择和设计合成。其次，探讨不同性质靶蛋白与核酸库中适配体高亲和高特异结合的机理和规律，初步阐明影响靶蛋白高特异性适配体筛选的化学和生物学因素，为靶蛋白的适配体筛选，提高筛选效率奠定理论和实验基础。目前国内外尚未见有关内容的研究报道

本课题研究毛细管电泳方法学和技术在蛋白质靶标的核酸适配体高效筛选中的应用。主要研究蛋白质靶标的核酸适配体筛选机理，蛋白质靶标的核酸适配体高效筛选存在的关键问题，以及毛细管电泳用于核酸适配体筛选的普适性方法。通过课题研究，提高了对核酸适配体筛选的关键问题的认识，如核酸库的合理设计，核酸分子对靶标的亲和力和特异性的矛盾，快速筛选平台建立的必要性等。. 进展如下：建立了靶蛋白的性质评价方法；研究了核酸库质量的影响因素及分级分离方法；建立了多模式毛细管电泳用于靶标与核酸相互作用的快速预判方法。初步建立了小分子、细胞和微生物多尺度靶标的核酸适配体筛选方法。初步研究了利用靶蛋白的双核酸探针识别，高灵敏分析蛋白质的邻位连接分析方法，为拓展核酸适配体用于蛋白分析检测的应用空间奠定基础。. 具体内容包括：1）蛋白质靶标性质分析；2）核酸库质量的影响因素及核酸库的分级分离；3）多模式毛细管电泳表征靶蛋白与核酸库相互作用；4）低pH-CE模式用于蛋白质靶标的核酸适配体筛选；5）毛细管电泳柱上反应模式快速筛选蛋白质核酸适配体；6）微生物,细胞和小分子靶标的核酸适配体筛选研究；7）基于双核酸探针识别的蛋白质邻位连接分析；8）其它毛细管电泳分析研究。