miRNA和siRNA在生物调控网络中若干关键特征分析和识别

从已有的基因序列特征出发，根据全面的癌症实验数据，分析和提取实验的统计信息和序列特征信息，力求发现具有相关的生物序列特征和调控网络特征，从miRNA和siRNA角度认识、发现和识别生物调控规律。具体完成以下几项工作：1、通过建立基因、蛋白质、DOMAIN、miRNA和siRNA相互关联的数据库，以癌基因为基础，根据各种癌症的实验数据，分析和识别实验数据和生物网络相关特性。2、采用已被证实RNA病毒致癌的特性，研究致癌的病毒、siRNA、致癌基因的相互关系，总结和发现癌基因、siRNA和病毒生物调控网络特征。3、研究siRNA和miRNA的相互关系，从实验数据和序列特征比较两者的作用，认识和发现两者的序列特征、生物调控网络特征，判断siRNA是否与miRNA的某些调控功能相同。4、采用人工智能、模糊计算、聚类、贝叶斯分类、自动推理等技术发现miRNA和siRNA的生物调控规律。

癌症仍是人类难以攻克的恶疾，医学研究者发现癌症的预测、发生和治疗都与基因、miRNA有密切关系，病毒也会影响癌症的发生，同时研究表明siRNA与miRNA在序列和功能上有相似之处，通过siRNA来预测miRNA的功能将是治疗癌症的一种可行的策略。我们研究的主要内容包括：癌症相关的病毒同癌症机制的研究；siRNA与miRNA的共性和特性对比分析，发现一些miRNA和某些siRNA具有相同结合位点序列，它们可能具有相近的功能，从而通过siRNA来分析miRNA在癌症中潜在的功能；分析siRNA，miRNA与病毒在癌症中的作用。基于癌症的实验数据，主要是癌症相关（差异表达和非差异表达）的基因、miRNA及其调控关系构建和分析了基因与miRNA组成的癌症网络，构造了癌症的3种网络：差异表达网路，相关表达网络，总表达网络。提取了3种网络中关键调控关系并对比分析了它们的特点，提取了各种癌症中转录因子与miRNA间相互调控的重要关系。开发 miRNA与病毒的分析程序、siRNA与病毒的分析程序、同族病毒的比对程序以及病毒的小RNA致癌特征分析软件。构建基于实验数据（癌症相关的基因与miRNA）的各种癌症调控网络，并构建相关的生物网络数据库。我们的研究部分地揭示了癌症的发病机理，部分地揭示了病毒，miRNA，siRNA，基因在癌症中的作用，它们对癌症产生作用的机制。