红碱淖湿地遗鸥繁殖种群组成和遗传结构研究

To investigate population characteristics,evolutionary history and phylogenetic relationship of Relict gull (Larus relictus) breeding populations from different islets in Hongjian Nur, Shaanxi Province, the RAD-tag，complete mitochondrial genomes and partial genes of Cyt b、COI and control region of individuals collected through noninvasive methods from different lake islets and different nest groups in the same lake islet will be sequenced. These data will be used to analyze the genetic polymorphism, genetic structure and to infer the evolutionary history of these breeding populations, and population composition through combining long term observation data on migration and breeding behavior (nest construction, nest-site selection and laying time etc), and will also reconstruct the phylogenetic relationship between Relict gull and other gull birds using complete mitochondrial genome sequences. This study will provide scientific background knowledge for establishment of nature reserve, evaluation the species endangous status and efficient conservation management of this endangered species.

为准确掌握目前陕西红碱淖遗鸥繁殖种群的组成特征，有效推论遗鸥种群进化历史和发展趋势，对红碱淖遗鸥筑巢繁殖的不同湖心岛和每个湖心岛上的不同巢群进行无损伤取样，进行高通量RAD测序、线粒体基因组和Cytb、COI基因序列及控制区测序。通过对高通量RAD测序获得的大量核基因组序列和线粒体基因组3个序列片段构建的单倍型网络和基因谱系树，推断遗鸥群体遗传多样性和遗传结构，分析种群演化历史，并结合项目组十年来对红碱淖遗鸥繁殖群体迁徙时间、筑巢结构、巢址选择、产卵时间等行为学和生态学方面的监测数据，分析目前红碱淖遗鸥繁殖种群组成；最后利用线粒体基因组数据建立稳健的遗鸥与其他鸥科鸟类的系统发育关系。所获得的基因组数据对遗鸥种群谱系生物地理学研究具有重要意义，并为建立遗鸥保护区、重新评估遗鸥受胁状况，实现对遗鸥种群的有效保护提供科学依据。

对陕西红碱淖自然死亡的遗鸥幼鸟进行了线粒体全基因组和线粒体Cytb和控制区测序。利用这些数据重建了遗鸥与其他鸥科鸟类的系统发育关系，确定了遗鸥的系统分类地位，初步推论了其进化历史。结果支持遗鸥位于黑头鸥族，棕头鸥位于面具鸥族。遗鸥与地中海鸥和渔鸥亲缘关系较近，与棕头鸥关系较远，不支持遗鸥是渔鸥和棕头鸥的杂交种。通过控制区序列分析的结果不是十分理想，项目组加测了线粒体ND2基因和核MUSK intron 3基因全序列。从线粒体和核基因两种不同的遗传方式进行综合分析，探究遗鸥种群的结构，这项任务相关论文项目组正在整理中。2013年5月底在陕西定边苟池湿地发现有434巢遗鸥繁殖群分布。