中国大陆-台湾省间断分布濒危植物六角莲亲缘地理学和保护遗传学研究

基于六角莲叶绿体cpDNA序列变异数据，分析六角莲群体叶绿体单倍型的地理分布规律及单倍型系统发育关系；通过与外类群序列比较，确定古老单倍型及其分布地；进行网状支系分析（NCA），推测不同支系曾经历的历史事件；最后，结合古地理、古植被生态、古气候变迁资料，揭示濒危植物六角莲现代地理分布格局的形成原因。应用AFLP分析方法对六角莲群体遗传变异状况进行研究，结合cpDNA序列数据，查明六角莲群体遗传变异的时空格局，并剖析历史因素、岛屿地理隔离、居群面积等对六角莲居群遗传结构的影响，阐明遗传变异和分化的影响因子。根据cpDNA及AFLP标记数据，计算不同居群对整个物种遗传多样性和等位基因丰富度的遗传贡献率，确定优先保护种群，提出科学的保护策略。本研究也为其它中国大陆和台湾省间断分布濒危种的亲缘地理和保护遗传学研究提供方法指导。

运用AFLP技术对194个个体分析，70.1%条带具有多态性。主成分分析和UPGMA聚类分析表明六角莲群体已经出现了明显的遗传分化。9个六角莲群体主要分成两组：台湾地区群体和中国大陆群体，群体间基因交流很少，基因流Nm＝0.3428。.　　　叶绿体trnL–trnF, trnF–ndhJ和trnS–trnfM基因间隔区测序以及AMOVA估测群体间和群体内的差异，在物种水平上，六角莲cpDNA数据表明该物种具有较高的单倍型多样性和核酸多样性(hT = 0.933; πT = 0.0016)。六角莲群体存在着明显的群体分化，NsT显著大于其相应的GsT 值(U = 10.68，P < 0.001)，存在明显的谱系地理结构。 将中国大陆群体和台湾岛群体作为2个地理组进行AMOVA分层次分析，57％的叶绿体DNA序列变异存在于组间，31％ 的变异存在与组内群体间，而仅有12％的变异是处于群体内个体间。遗传距离和空间距离的相关性分析表明，六角莲的整个分布区内群体间的遗传距离和地理距离之间没有显著相关性。.　　　六角莲9个群体121个个体，3个cpDNA-IGS 间隔序列共得到27个单倍型。叶绿体单倍型的地理分布表明，六角莲群体间在cpDNA水平存在一定程度的隔离。.　　　群体内单倍型多样性(hS) 和核酸多样性(πS)在六角莲群体间变化很大，群体内单倍型多样性(hS)平均值为0.3724 ± 0.226，核酸多样性 πS (×10-3) 的平均值为0.232 ± 0.146。单倍型多样性(hS)和核酸多样性（πS）与海拔和经纬度没有相关性。. 单倍型网络图初步分析发现，台湾单倍型和大陆单倍型之间存在强烈的分化，除了来自戴云山的单倍型H25在拓扑结构上和台湾支系聚在一支，两者完全被分成了两个单系类群，支持率分别为82％和75％。两个谱系的遗传多样性比较分析表明，中国大陆谱系六角莲群体有相对较长的进化历史和较大的有效群体大小。.利用dual-suppression-PCR方法成功完成了14对SSR引物开发，并在浙江天目山完成了六角莲的繁育系统与传粉生态研究，确定六角莲的主要传粉昆虫是斑跖齿股蝇(Hydrotaea chalcogaster)，其访花频率为 0.43 ± 0.03个昆虫每花每小时。六角莲的繁育系统为自交不亲和（Self-incompatible)