中国近海水螅水母类DNA条形码及分子系统学研究

基本信息
批准号:41006078
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:21.00
负责人:郑连明
学科分类:
依托单位:厦门大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:林元烧,方旅平,杨位迪,王宇杰,张达娟,张建平,潘非斐
关键词:
线粒体基因组分子系统学水螅水母类DNA条形码
结项摘要

海洋水母类物种的准确鉴定及其独特而复杂的系统演化一直是系统分类学、进化学及生态遗传学面对的难题之一。本项目以中国近海水螅水母类为研究对象,通过基因组分析和统计学手段,建立筛选方法,确定适用于各类群物种鉴定的DNA条形码标准基因,探讨隐存种多样性研究的理论和方法;重点研究水螅水母类典型种线粒体基因组全序列的遗传结构,阐明线粒体基因组中各基因的进化速率,基于DNA条形码标准基因及线粒体基因组全序列,从序列层次和结构层次探讨水螅水母类系统进化关系,揭示水螅水母类系统发育相关的重要进化事件及其规律。本项目研究结果为今后不同阶元的水母类系统学研究提供崭新的技术手段和重要科学依据,推进海洋水母动物的系统分类和系统发生研究的发展,并为我国海洋生物多样性保护及探讨水母暴发、入侵等生态事件提供重要的生物学资料。

项目摘要

海洋水母类物种的准确鉴定及其独特而复杂的系统演化一直是系统分类学、进化学及生态遗传学面对的难题之一。本项目研究成果包括:1)以中国近海水螅水母类为研究对象,通过基因组分析和统计学手段,确定以线粒体16S rRNA作为水螅纲的DNA条形码标准基因;并基于16S rRNA序列,首次较系统地建成我国近海水螅水母类DNA条形码数据库;最后,通过DNA条形码标准基因发现中国近海水螅水母类7个新种,并提出DNA条形码和传统形态特征相结合是描述物种的关键,而且应该作为未来水螅水母分类学的标准方法。2)首次基于核内18S rDNA和线粒体16S rDNA两种基因序列重建系统发育树,探讨我国近海和平水母科(Eirenidae)各属分类地位及亲缘关系;首次基于核内ITS1和线粒体COI两种基因序列探讨我国近海和平水母属(Eirene)的系统发育关系,结合分子学和形态学特征,主张将现存的和平水母属分为两个类群:宽胃柄群和窄胃柄群。3)通过设计一套特异引物,已成功扩增并组装出中国近海常见种四叶小舌水母(Liriope tetraphylla)16024 bp线粒体基因组序列,覆盖了其线粒体基因组中全部蛋白质、转运RNA及核糖体RNA编码序列。本项目研究结果为今后不同阶元的水母类系统学研究提供崭新的技术手段和重要科学依据,推进海洋水母动物的系统分类和系统发生研究的发展,并为我国海洋生物多样性保护及探讨水母暴发、入侵等生态事件提供重要的生物学资料

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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