活性多肽溶液空间结构的核磁共振研究

广西眼镜王蛇毒液捉取物CM-11。为含五对双硫键，由72个残基组成的长链神经毒素。对其水溶液（PH=3.5,T=297K),进行了DQFCOSY、TOCSY、NOESY等一系列二维NMR研究。在完成其氢谱谱线完全归属的基础上，用主链引导法等方法，确定了其二级结构：含三段反平B折叠服（I20-W26、R37-A43和V53-S59），一段又螺旋构象（W30-G35）和四个可能的转角（P7-K10、C14-G17、K50-V53、D61-N64）；由NOESY和DQFCOSY谱获取距离和二面角约束条件，利用度量距离几何计算了初始结构。再用模拟退火法和分子动力学方法进行优化。确定了CM-11的溶液空间结构。12个但能分子的骨架和所有重原子的RMSD分别为0.14nm和0.20nm。距离约束偏差不超过0.05nm,二面角偏差≤3(0)。