生物基因表达数据中局部模式的挖掘与研究

基本信息
批准号:60903081
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:17.00
负责人:季丽萍
学科分类:
依托单位:哈尔滨工业大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:温晓军,白雪峰,黎丽,王莘,刘佳,赵留长,公延军
关键词:
基因表达数据局部模式数据挖掘疾病及致病基因预测基因调控网络预测
结项摘要

生物基因表达数据中局部模式的挖掘与研究,是破译基因功能、发现基因调控网络的关键,在众多领域中都有着广泛的应用,已成为近年来生物信息学研究的热点。本课题将针对这一热点,对基因表达数据中的局部模式进行系统的定义和分类,并针对不同的局部模式,设计高效准确的数据挖掘算法,解决由于生物数据的高维度、高密度、大规模、和生物模式的复杂性为算法设计带来的困难。同时,结合生物领域的背景知识,运用统计学的方法建立局部模式的评价体系,对挖掘的结果进行筛选,以提高局部模式的生物意义。最后,在局部模式的应用研究方面,我们将利用局部模式和相关的生物背景知识,设计高效准确的分类器,实现对基因调控网络的预测,和疾病及致病基因的预测。本课题的研究不仅会为生物信息领域提供理论基础和应用工具,还将拓宽数据挖掘领域关于局部模式的定义和算法研究,并为局部模式挖掘在其他众多领域中(如经济、农业、军事等)的应用做出指导。

项目摘要

生物基因表达数据中局部模式的挖掘与研究,是破译基因功能、发现基因调控网络的关键,在众多领域中都有着广泛的应用,已成为近年来生物信息学研究的热点。本课题针对这一热点,对基因表达数据中的局部模式进行了系统的定义和分类,并针对不同的局部模式,设计出高效准确的数据挖掘算法。同时,结合生物领域的背景知识,运用统计学的方法,提出局部模式的评价方法,用以对挖掘的结果进行筛选,以提高局部模式的生物意义。最后,在局部模式的应用研究方面,我们利用局部模式和相关的生物背景知识,设计了分类器,用以对基因调控网络进行预测,并对如何提高分类器的分类效果进行了研究。本课题的研究不仅会为生物信息领域提供理论基础和方法,还将拓宽数据挖掘领域关于局部模式的定义和算法研究,并为局部模式挖掘在其他众多领域中(如经济、农业、军事等)的应用做出指导。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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