人和小鼠睾丸芯片差异基因库的生物信息学分析及其表达研究

基本信息
批准号:30700824
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:16.00
负责人:唐爱发
学科分类:
依托单位:北京大学
批准年份:2007
结题年份:2010
起止时间:2008-01-01 - 2010-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:余振东,刘维湘,李贤新,孙烁磊,刘群龙,彭菲,张立兵,张键荣
关键词:
生物信息学生精障碍男性不育精子发生
结项摘要

本项目在3个数据库: (1) 4、9、18、35、54日和6月龄小鼠睾丸Affymetrix芯片差异表达基因谱(含2058个基因),(2) 胚胎期和成人睾丸差异基因谱(含3018个基因)和(3) 按Johnsen分数分类的29份生精障碍患者睾丸库的基础上, 用双聚类算法分析基因间及基因和表型间的关系; 流形学习的方法分析基因的相互关系; GeneRank方法创建基因-基因互作网络; 以半监督学习方法,实现显著基因的挑选、未知基因的分类和功能预测; 经上述分析,选5~10个基因, 半定量RT-PCR、Western Blot和免疫组化等分析其在29份生精障碍患者睾丸中的mRNA和蛋白质的表达;其中的2~3个基因,在细胞和动物RNA干扰模型中分析其生物学功能。.本项目通过分子生物学和生物信息学的结合运用, 将为寻找男性不育症的致病基因及哺乳动物精子发生中的内在机理提供新见解。

项目摘要

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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