基于基因功能模块化概念的基因表达谱数据挖掘技术

由于基因表达谱数据具有高噪（高变异）、高维、高相关、高冗余的特点，加之单个基因的功能知识不完备、不精确，使得基因表达谱信息分析结果的稳定性、可靠性与生物学可解释性较差，是基因芯片技术应用中亟待解决的关键问题。单个基因的检测指标并非是理想的分析单元，为此，本课题将发展基因表达谱数据挖掘的创新技术，整合基因功能划分的先验知识，研究基因表达功能模块化的概念及相关的模块化指标，以解决现有分析技术存在的上述问题。我们将完成基于功能模块化的基因表达谱数据挖掘应用软件，并应用于挖掘已有的一些白血病、直肠癌、乳腺癌等基因表达谱数据资源中的知识。从依靠基因型区分表型到依靠功能型区分表型的思路转变，使得我们可以选择不同层次的基因功能知识单元解释不同层次的样本划分或疾病分型。从"功能模块表达谱"出发进行知识发现，将是基因芯片数据挖掘技术的一个重要突破。