基因调控序列的信息学识别及若干肿瘤相关基因调控序列的确定

从基因组数据库中，提取生物学意义相关、受共同因素调节的肿瘤相关基因序列及其转录起始点上游包含顺式作用元件的DNA序列，构建原始序列数据集。采用序列模式搜索等数据挖掘技术，从数据集中识别出形式相似、出现频率较高的序列片段及其相应的序列模式，预测这些序列片段的基因调控特性。利用PCR技术扩增这些由信息学方法识别到的序列片段，再利用迁移率变动分析（EMSA），验证这些片段的蛋白质结合特性。对于能够和蛋白质结合的DNA，进一步利用足迹法确定DNA上的蛋白质结合核苷酸序列，并将这些具体序列定位到基因组上。最后，总结肿瘤相关基因中调控元件的类型及其同疾病之间的关系。