适用于膜蛋白的高效固体NMR新方法研究

基本信息
批准号:21775161
项目类别:面上项目
资助金额:64.00
负责人:张正逢
学科分类:
依托单位:中国科学院精密测量科学与技术创新研究院
批准年份:2017
结题年份:2021
起止时间:2018-01-01 - 2021-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:赵伟静,李建平,马涛,赵永祥,邓静,谭欢
关键词:
魔角旋转膜蛋白三维结构方法固体核磁共振
结项摘要

Magic-angle spinning (MAS) solid-state NMR (ssNMR) is regarded as one of the most perspective techniques to elucidate three-dimensional structures of membrane proteins (MPs) in native-like phospholipid membranes. However, compared to the mature analytical techniques such as X-ray diffraction and solution NMR, multi-dimensional ssNMR experiments are so time-consuming that the term of structural characterization of MPs by ssNMR is very long. At present, the time-consuming multi-dimensional ssNMR experiments have been a major factor that limits the structural determination of MPs. In this project, we will develop two highly efficient ssNMR methods, using optimal-control NMR simulations which include the characteristic variables of structural and dynamical features of MPs. The methods are developed for heteronuclear/homonuclear dipolar recoupling or spectral editing. Using these methods, we can improve the efficiencies of magnetization transfer or spectral editing, and hence establish a suit of fast multi-dimensional ssNMR experiments to reduce the experimental time by a factor of 2-4. The project is expected to greatly accelerate the structural studies of MPs by ssNMR.

魔角旋转固体NMR可在磷脂膜中研究膜蛋白,被认为是解析膜蛋白三维结构的最有前途的技术之一。但是,与X-射线衍射和液体NMR等成熟的分析技术相比,固体NMR的多维实验非常耗时,导致固体NMR研究蛋白质结构的周期非常长。目前,耗时的固体NMR多维实验已经成为制约固体NMR解析膜蛋白三维结构的主要因素之一。本项目拟以NMR模拟为主要工具,在模拟中嵌入反映膜蛋白结构和动力学的特征变量,利用基于优化控制的模拟策略,发展适用于膜蛋白的高效固体NMR新方法——固体NMR异核/同核偶极重耦方法和谱编辑方法。应用这些新方法,提高固体NMR实验中的磁化传递效率或谱编辑效率,从而建立一组更适用于膜蛋白的快速的固体NMR多维实验,将实验时间缩短至当前的1/4~1/2。预计本项目的顺利实施将极大地加速固体NMR解析膜蛋白三维结构的研究。

项目摘要

高效的固体NMR方法是促进固体NMR研究膜蛋白的主要因素。本项目建立了以相位优化为主要策略,结合与蛋白质相关的NMR参数特征,发展了3种更适用于膜蛋白的、更高效的固体NMR新方法。我们发展一种具有频带选择性的13C-13C同核重耦方法PR5,能够将蛋白质中13Cα-13Cβ的传递效率提高~ 60%,从而将实验时间缩短至40%;发展了一类具有频率选择性的同核重耦SPR-Nn方法及其理论,实现了在不同旋转条件下的1H-1H或13C-13C相关信号的选择性增强,有利于探测与结构相关的距离信息;设计了一种基于13C化学位移差异的谱编辑技术,简化了固体NMR多维相关谱,有利于膜蛋白的信号分析。这些新方法将促进膜蛋白以及药物的固体NMR研究。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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