小分子药物与非编码RNA功能关系的识别与研究

Non-coding RNA(miRNAs/lncRNA) is closely related to tumorigenesis and development. Small molecular compounds have been proved to affect gene expression. Developing specific drugs targeting dysregulated ncRNAs for patients , restoring dysregulated ncRNAs,will be a novel strategy for cancer therapeutics . In this project, we will integrate phenotypic similarities and functional similarities for constructing a model of identifying associations between small moleculars and ncRNAs. Which is implemented based on response data with transcription factor, target gene data and disease data related to small moleculars and ncRNAs. Furthermore, we will predict the ncRNA targeted anticancer drugs through functional analysis of the small molecular-ncRNA networks. We will also construct one-stop platform for ncRNA-based pharmacogenomics analysis. Finally, the predicted results will be validated by molecular biology and pharmacology experiment valification. In a word, this project will provide the computational approaches and tools for ncRNA associated drug discovery and personalized medicine.

非编码RNA（miRNA/lncRNA）与癌症的发生、发展密切相关，小分子化合物能够通过多种途径影响非编码RNA的表达。开发靶向患者体内表达失调的非编码RNA的特异药物，使其表达恢复正常，是一种全新的癌症治疗策略。因此，本项目将基于大量的小分子干扰的转录反应数据、多种小分子和 ncRNAs 相关的蛋白质功能网络信息及疾病信息等，通过整合小分子干扰的转录反应和 ncRNA 影响的转录反应之间的功能相似性和小分子相关疾病与 ncRNA 相关疾病之间的表型相似性，构建小分子-ncRNA 关联关系识别模型。通过对构建的小分子-ncRNA的分子网络进行深入的拓扑性分析和功能分析，预测潜在的ncRNAs 生物药物和药物作用靶点，开发与小分子相关的ncRNA关系数据平台。最后，对候选药物进行分子生物学和药理学实验验证。本项目将为ncRNA靶向药物的研发以及个性化医疗提供重要的参考和分析工具。

非编码RNA与癌症的发生、发展密切相关，小分子化合物能够通过多种途径影响非编码RNA的表达。开发靶向患者体内表达失调的非编码RNA的特异药物，使其表达恢复正常，是一种全新的癌症治疗策略。因此，本研究大规模整合了多种小分子药物与非编码RNA的多种生物学相关数据，包括小分子药物治疗的疾病数据，lncRNA相关的疾病数据及其二者相关的蛋白质功能数据。其次构建了识别小分子-lncRNA 关联关系识别模型。对识别预测的小分子-lncRNA的分子关系，分别进行了多个层面的功能分析和生物学证实。包括对构建的预测的小分子-lncRNA的功能网络进行深入的网络的拓扑性分析和功能性分析并基于预测的小分子与lncRNA关系开发了药物重置的方法，一方面是对预测关系的验证，另一方面也是预测的小分子-lncRNA的潜在关系对药物重置层面的应用。此外，对小分子-lncRNA进行了网络模块的挖掘，并通过文献挖掘进行了进一步的验证。最后，为临床药物筛选提供了可作为候选的小分子相关的lncRNA关系数据。本项目将为非编码RNA靶向药物的研发以及个性化医疗提供重要的参考和分析数据。