云南野生半野生柑橘种质资源收集、保存及遗传多样性评价

Yunnan is one of the origin centers of citrus, where are rich of wild, semi-wild and landrace citrus germplasm resources, and many resources are unique to the region. However, with the construction and development of the regional economy, many rare resources of citrus are in endangered. In this study, we will systematically carry out the survey, collection and conservation of local wild, semi-wild and landrace of citrus resources in Yunnan. According to the result of comprehensive analysis by the morphology, sugar, acid and bitter substances of fruit, nuclear SSRs and SNPs, chloroplast SSRs, it will give insights into the genetic diversity and genetic relationships in these rare resources, which will lay a foundation for scientific conservation and exploiting local unique Citrus germplasm resources in future.

云南是柑橘起源中心之一，野生、半野生及农家品种柑橘资源十分丰富，许多资源为该地区所独有。然而随着地区经济的建设与发展，很多珍稀柑橘资源濒临灭绝。本研究拟系统开展云南地区野生、半野生及农家品种柑橘种质资源的调查、收集与保存。通过形态学分析，果实糖酸及苦味物质分析，基于核基因组的SSR与SNP、叶绿体基因组SSR分子标记技术，综合分析该地区野生、半野生及农家品种柑橘种质资源的遗传多样性，为科学保护和开发利用该地区独特柑橘资源奠定基础。

本研究共收集云南野生、半野生及农家柑橘资源201份，并系统开展相关资源的苦味物质柚皮苷、橙皮苷及类黄酮含量测定及基于SSR和全基因组SNP标记分析，结果表明：柚皮苷主要分布在宜昌橙、大翼厚皮橙、枸橼、柚及红河大翼橙的成熟果实的黄皮层中，在橘中含量较低；橙皮苷主要在橘、宜昌橙、橙、大翼厚皮橙、枸橼及红河大翼橙的成熟果实的黄皮层中；类黄酮总量在橘、宜昌橙、大翼厚皮橙、枸橼、柚及红河大翼橙的成熟果实的黄皮层中均有分布，但在橘和红河大翼橙中含量较高，宜昌橙中含量较低；基于SSR及全基因组SNP位点分析，证实云南元江宜昌橙和云南红河大翼橙均是柚与橘的杂交种，云南元江宜昌橙基因组信息中有67.56%来源于柚，26.45%来源于橘；云南红河大翼橙基因组信息中有83.38%来源于柚，13.69%来源于橘；云南百年宽皮桔起源比较复杂，推测其来源于柚与橘的二次杂交；水晶蜜柚和云南三个野生柚资源，其基因组信息超过90%均来源于柚，属于真正的柚类。相关研究结果为今后深入开发利用云南柑橘资源奠定了重要基础。同时，依托该项目发表论文3篇，培养硕士研究生1名。