基于SLC25A13基因新突变识别、诊断和筛查的NICCD深入研究

基本信息
批准号:81070279
项目类别:面上项目
资助金额:32.00
负责人:宋元宗
学科分类:
依托单位:暨南大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李冰肖,陈凤平,唐晖,刘芳,陈文超,何伟仪,郭丽,文芳,邓梅
关键词:
高分辨率溶解分析基因诊断突变胆汁淤积肝脏
结项摘要

Citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症(NICCD)是近年来新发现的一种严重危害我国婴儿健康的遗传代谢性肝病,其确诊依赖SLC25A13基因分析。SLC25A13突变具有明显的异质性,其种族和地区分布的差异性也比较突出,因此识别我国人群SLC25A13新突变并建立低成本、高通量和高灵敏度特异度的突变检测方法至关重要。本研究以课题组多年NICCD诊断治疗和SLC25A13突变分析工作为基础,应用DNA直接测序、LA-PCR、定量PCR和家系SNP分析等技术识别NICCD患者SLC25A13新突变,建立分子诊断方法并应用于后续突变筛查。然后探索应用高分辨率溶解分析法(HRMA法)进行SLC25A13基因分型和突变筛查的实验条件,并深入研究SLC25A13基因型与NICCD表现型的相关性。本项目可为加深对NICCD实验室特征的科学认识补充新资料、提供新方法,具有重要科学意义和学术价值。

项目摘要

在国家自然科学基金资助项目81070279支持下,课题组应用DNA直接测序、LA-PCR、cDNA克隆和家系SNP分析等技术,确诊NICCD患者168例,其中含马来西亚患者4人;发现SLC25A13基因新突变18种(V411M, G283X, c.2T>C, c.754G>A, D350N, R355G, G139R, R455L, Y24X, c.R355Q, c.265delG, IVS4ins6kb, K405N, c.845_c.848+1delG, Q592P, V264I, V474M和M35V);首次在人外周血淋巴细胞中发现新的mRNA剪接变异体26种,并在NICCD患者中发现致病mRNA分子两种(r.16_212dup和r.329_468del)。应用高分辨熔解分析法(HRMA)研究了广东人群中高频突变851_854del, IVS6+5G>A, 1638_1660dup, IVS16ins3kb和 g.1399C>T的分布特征,发现珠三角外围地区人群上述突变携带率高于珠三角(1/4400 vs 1/14400,卡方值=4.639,P<0.05),广东人群Citrin缺陷病理论患病率为1/8800,根据Hardy-Weinberg 定律计算,广东省至少存在本病患者11800人。在SLC25A13基因型研究的基础上,对NICCD患者胆汁淤积、蛋白、脂类、酶学及金属离子等生化指标的改变特点做了深入分析,发现上述生化表型指标与SLC25A13基因型之间不存在具有统计学意义的相关性。总之,本课题研究为广东人群Citrin缺陷病危害评估提供了初步的分子流行病学数据,丰富了SLC25A13基因突变谱,深化了对NICCD实验室特征(包括SLC25转录产物结构特征)的科学认识,从而圆满完成了项目研究任务。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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