家马地方品种重要经济性状候选基因的遗传多样性及人工选择信号研究

Horse industry is lagging and traditional in Chinal,although there is the most horse inventories. However, within developed countries, modern horse industry which focuse on sports and entertainmentsis has accounted for GDP and employment. Thus, economic traits and its candidate genes of horse which is particularly concerning by modern horse industry have important scientific value and socioeconomic benefits. For this reason, we will research six candidate genes related to horse figure, athletic ability and resistance traits with high-flux sequencing and SNPs scanning based on 300 samples from 20 Chinese and five foreign endemics horse breeds. Our aim was to demonstrate the genetic diversity and the region or locus affected by artifical selection on candidate genes of different hores breeds.To distinct demographic history from the detection of artifical selection, we use a neutral evolution gene as reference, as well as, compare sequences of the six candidate genes between five wild horses(Equus Przewalskii) and 300 domestic horses from 25 endemics breeds.Our results will help speed up the application of Marker-assisted Breeding in the breeding of domestic horses and the development of modern horse industry in China.

中国虽然是世界上养马最多的国家，但仍处于落后的役用为主的传统马业阶段。在欧美发达国家，以竞技、娱乐为主的现代马业已成为一项贡献大量GDP与就业机会的支柱产业。因此，现代马业关注的家马性状及其候选基因将具有重要科研价值和经济效益。本项目选取与家马外观、竞技性、抗性相关的6个基因，通过大规模测序与SNPs扫描方法，研究我国20个与国外5个家马地方品种共300份样本的遗传多样性，同时与5份普氏野马的相应基因序列比较，并选取一个假基因为参照进行人工选择信号的检测。旨在寻找候选基因具有较高遗传多样性的地方品种，挖掘候选基因上具有重要育种价值的人工选择作用区域或位点，为进一步开展我国家马地方品种的分子育种提供有用信息，对促进我国现代马业的建立和发展具有积极意义。

在欧美发达国家，以竞技、娱乐为主的现代马业已成为一项贡献大量GDP与就业机会的支柱产业。 因此，现代马业关注的家马性状及其候选基因将具有重要科研价值和经济效益。本项目选取与家马外观、竞技性、抗性相关的MSTN基因、ACE基因，以及6个微卫星位点TKY015、UM012、TKY222、COR008、COR001、IGF1-p进行研究。通过先测定高矮马各30份初步分析发现ACE基因没有发现插入或缺失，对高、矮马耐力方面的差异并没有影响。6个微卫星位点中TKY222、COR008、COR001、IGF1-P位点连锁与耐力相关的候选基因的变异。在MSTN基因上发现了15个SNP，其中启动子区域（g.32、g.85），以及内含子1（g.1033、g.1063、g.1283、g.1071）在高矮两个类型组中的基因型频率差异明显。随后，我们在168份不同高度的家马样本上测定了MSTN基因的启动子与内含子1区段，共发现14个SNP在体高140cm以上，体高130cm-138cm，体高120cm-128cm），体高106cm以下的四个体型组别中的基因型频率差异明显。为了探究MSTN基因在高矮马上的频率差异是否为家马选育过程所特有，我们还测定了马属另一个家养物种驴，共测定了高中低体型来自中国5个地区的55份样本，发现g2014，g2302在三种体型驴的基因型频率有明显差异。因此，我们推测MSTN基因在马属两种家养动物的体型驯化过程中都受到了人工选择的影响。本项目寻找到的部分与体型人工选择作用有关的区域或位点，为进一步开展我国家马地方品种的分子育种提供了有用信息，对促进我国现代马业的建立和发展有重要意义。