基于通用CPU SIMD指令集的基因序列联配高性能算法研究
基本信息
批准号：60372040
项目类别：面上项目
资助金额：7.00
负责人：冯圣中
学科分类：
依托单位：中国科学院计算技术研究所
批准年份：2003
结题年份：2004
起止时间：2004-01-01 - 2004-12-31
项目状态： 已结题
项目参与者：张法,李玉岗,焦移山,曹振南,唐淼淼,冯高锋,徐琳,徐竞
关键词：
细粒度并行通用CPU基因序列比对SIMD指令集高性能计算
结项摘要
本项目将以面向SIMD的启示性优化算法为主要研究内容。以动态规划算法思想改造启示性算法，提高其敏感性；同时面向SIMD指令集，优化算法，减少条件转移、规整循环体结构，大幅提高计算速度。进一步，在广泛考察和深入分析生物信息处理算法基础上，提炼出生物信息处理基本算法，并开展优化设计研究。.生物信息处理与传统的科学计算差异巨大：生物信息处理主要为定点计算、循环迭代规模不确定、条件转移指令比较多，目前还没
项目摘要
项目成果
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数据更新时间：2023-05-31
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