Nogo蛋白家族基因SNPs及拷贝数变异与鼻咽癌的分子机制研究

基本信息
批准号:81560461
项目类别:地区科学基金项目
资助金额:37.00
负责人:王俊利
学科分类:
依托单位:右江民族医学院
批准年份:2015
结题年份:2019
起止时间:2016-01-01 - 2019-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:唐任光,潘国刚,杨凤莲,韦贵将,胡仁统,元辉雄,王怀飞
关键词:
Nogo蛋白家族拷贝数变异C03_鼻咽肿瘤基因单核苷酸多态性
结项摘要

Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a head and neck malignant cancer which is seriously harm to middle age and old people health, however, its etiology and pathogenesis have not yet fully understood. Nogo protein family gene is a novel gene which may be involved in tumorigenesis, but its mechanism involved in the incidence of tumors is not clear. Up to date, no data to studies, have examined the association of the Nogo protein family gene with NPC. In the previous National Natural Science Foundation study, the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of Nogo protein family gene were examined by the polymerase chain reaction-single base extension technique and DNA sequencing methods in case-control study populations. Based on the previous basis, in this study, we plan to examine the relationship between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and copy number variation (CNV) of Nogo protein family gene and risk of NPC by the polymerase chain reaction and DNA sequencing methods. Additionally, the mRNA and protein expression of Nogo protein family gene in NPC were detected by Real-time PCR and Western blot techniques. To analysis association of mRNA and protein expression of Nogo gene with the gene mutations in NPC patients, and to investigate the function of Nogo gene expression regulation in patients with NPC. Reveal the molecular mechanism of Nogo protein family gene in occurrence and development of NPC, and provides the research foundation for the gene diagnosis and prevention of NPC.

鼻咽癌(NPC)是严重危害我国中老年人的一种头颈部恶性肿瘤,然其病因和发病机制尚未完全阐明。Nogo蛋白家族基因是新近发现的可能是参与肿瘤发生的一种新基因,但他通过何种机制在肿瘤中起作用尚不清楚。截止目前未见该基因在鼻咽癌中的研究。在参与的已结题国家自然科学基金前期研究中,我们课题组已经对Nogo蛋白家族基因SNPs进行了检测。在已有的前期基础上,本研究拟联合使用SNPs和CNV 两个遗传学标记,采用PCR和DNA测序技术检测Nogo蛋白家族基因SNPs 和CNV突变与鼻咽癌的关系。用Real-time PCR和Western blot等技术分别检测Nogo基因mRNA和蛋白的表达情况。分析Nogo基因突变对mRNA表达丰度及Nogo蛋白表达水平的影响,探讨Nogo基因表达调控的功能,揭示Nogo基因在鼻咽癌发生、发展中的分子作用机制,从而为鼻咽癌的基因诊断和疾病预防奠定基础。

项目摘要

鼻咽癌(NPC)是严重危害我国中老年人的一种头颈部恶性肿瘤,然其病因和发病机制尚未完全阐明。Nogo蛋白家族基因是新近发现的可能是参与肿瘤发生的一种新基因,但他通过何种机制在肿瘤中起作用尚不清楚。SNPs和CNV为重要的两个肿瘤遗传学标记,联合使用具有互补性的SNPs和CNV两个遗传学标记,探索Nogo蛋白家族基因遗传变异与鼻咽癌发生发展的相关关系,有助于揭示鼻咽癌中Nogo蛋白家族基因异常表达的分子机理,并鉴定出新的易感基因,找到鼻咽癌诊治新的靶点。故而,本研究联合使用SNPs和CNV 两个遗传学标记,采用PCR和DNA测序技术检测Nogo蛋白家族基因SNPs 和CNV突变与鼻咽癌的关系;用Real-time PCR和Western blot等技术分别检测Nogo基因mRNA和蛋白的表达情况;分析Nogo基因突变对mRNA表达丰度及Nogo蛋白表达水平的影响。研究结果表明:(1)广西人群Nogo 基因rs2919126 C/T 、 rs7575107G/T 、rs2920891A/C 、 rs17046647A/G、rs2588519 T/C 和 rs7582359 A/G共6个位点的基因多态性与与欧洲人、日本人和非洲人等不同种族和地区间存在着不同程度遗传差异。(2)Nogo蛋白血清、mRNA与组织蛋白在鼻咽癌中均不同程度高表达。(3)RTN4 基因(54972187-55137831)外显子区 9 个目的片段拷贝数变异( copy number variant, CNV) 与鼻咽癌发病风险无相关性。(4)RTN4基因rs2920891 A/C+C/C基因型增加了鼻咽癌发病风险,RTN4基因多态性rs2588510和rs1348528位点的单倍型CG和TA可增加广西壮族人群个体鼻咽癌易感性;RTN4基因 rs2255393 位点 TT 基因型为鼻咽癌发病的保护型遗传突变;RTN4基因多态性rs2864052和rs6445468位点的AG单倍型可降低广西人群个体鼻咽癌易感性。上述成果为进一步探讨Nogo基因表达调控的功能,揭示Nogo基因在鼻咽癌发生、发展中的分子作用机制,从而为鼻咽癌的基因诊断和疾病预防奠定基础和广阔的前景。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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