基于血清糖蛋白N-糖链差异谱建立胃癌诊断模型的初步研究

基本信息
批准号:30901729
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:20.00
负责人:刘文韬
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:瞿颖,蔡劬,李建芳,姚学新,刘卫仁,高翔,郑重
关键词:
糖组学胃癌凝集素亲和血清糖基化
结项摘要

糖蛋白质及糖基化的改变是肿瘤的重要特点,血清糖蛋白及其糖基化修饰与胃癌发生发展也密切相关。我们前期的研究发现胃癌血清差异蛋白质均为糖蛋白,为此本项目拟采用多凝集素磁珠亲和捕获血清中的糖蛋白质,利用PNGase F分离糖链,通过MALDI-TOF质谱技术比较胃癌患者术前、术后(5年生存以上)和正常人血清糖基化糖链的信息差异,建立预测胃癌发生的诊断模型。该项目旨在比较胃癌和正常人血清糖蛋白质组糖链的差异,探索一种以糖链差异为基础的胃癌诊断新模式,对提高我国胃癌的早期诊断水平具有重要意义,并为胃癌的糖组学研究奠定基础。

项目摘要

糖蛋白质及糖基化的改变是肿瘤的重要特点,血清糖蛋白及其糖基化修饰与胃癌发生发展也密切相关。本项目拟采用多凝集素磁珠亲和捕获血清中的糖蛋白质,通过MALDI-TOF质谱技术比较胃癌患者术前、术后(5年生存以上)和正常人血清糖基化糖链的信息差异,建立预测胃癌发生的诊断模型。本项目首先通过2D-DIGE技术鉴定出13个差异表达的胃癌血清蛋白质,为进一步研究奠定了基础。随后的研究中,我们利用WGA单凝集素亲和联合质谱技术初步建立的胃癌血清诊断模型,为下一步研究提供了技术保障。最后我们采用WGA,ConA和LCA多凝集素亲和血清技术亲和提纯血清中糖蛋白组中的糖链组, 随后通过MALDI-TOF质谱技术比较胃癌患者术前28例标本、术后7例标本和正常人血清标本20例糖基化糖链的信息差异,比较不同算法建立诊断模型,发现通过GA遗传算法统计法,选择4个差异峰(9293.45 m/z, 834.29 m/z, 4200.92 m/z, 2898.53 m/z)建立胃癌诊断模型,识别率达94.44%,准确性统计中正常组和胃癌组分别为88.89%和100%,其预测能力达到82.57%。最后再对混合验证组样本(本别含20例胃癌和20例正常对照)进行验证实验。GA敏感性算法和特异性最高均为100%。本项目旨在比较胃癌和正常人血清糖蛋白质组糖链的差异,探索建立一种以糖链差异为基础的胃癌诊断新模式,对提高我国胃癌的早期诊断水平具有重要意义,为胃癌的糖组学研究提供了方法。尤其为胃癌糖链修饰的进一步研究奠定了基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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