江西及周边地区家鸡品种遗传多样性和系统关系研究

江西省有丰富的地方家鸡品种资源，在列入了国家级品种保护名录的11个鸡品种中江西占了2个（丝毛乌骨鸡和白耳黄鸡），是我国具有较丰富家鸡品种资源的省份，而且江西家鸡品种具有各自独特的特点。周边地区如广东、湖北、安徽等地也有较丰富的家鸡品种资源。江西及周边地区不仅有丰富的遗传多样性，研究表明在家鸡的驯化及系统进化方面也是有突出贡献的。但是，本地区家鸡品种的遗传多样性并没有进行系统和完整的研究，品种间的系统关系和遗传进化也鲜有报道。本课题将就江西及周边省份的家鸡品种进行系统和全面的微卫星DNA遗传多样性检测，并利用线粒体DNA的D-loop高变区来分析品种的群体结构、网络关系及系统进化情况，利用线粒体全序列构建SNP图，通过不同变异位点分析来确定品种的遗传关系及生产性能，最后结合两者的统计结果对江西及周边地区家鸡品种的起源进化及遗传多样进行分析研究。

江西省有丰富的地方家鸡品种资源，在列入了国家级品种保护名录的11个鸡品种中江西占了2个（丝毛乌骨鸡和白耳黄鸡），是我国具有较丰富家鸡品种资源的省份，而且江西家鸡品种具有各自独特的特点。周边地区如广东、湖北、安徽等地也有较丰富的家鸡品种资源。江西及周边地区不仅有丰富的遗传多样性，研究表明在家鸡的驯化及系统进化方面也是有突出贡献的。但是，本地区家鸡品种的遗传多样性并没有进行系统和完整的研究，品种间的系统关系和遗传进化也鲜有报道。本课题利用线粒体DNA的D-loop高变区来分析品种的群体结构、网络关系及系统进化情况，利用鸡60KSNP芯片对不同品种进行多样性分析，再结合两者的统计结果对江西及周边地区家鸡品种的起源进化及遗传多样进行分析研究。本试验有5个支系（A、B、C、E和G）存在于江西及周边地方鸡种中，以A、B和E为主导支系，其中E支系主要存在于乌骨鸡中，及泰和乌鸡和余干黑鸡。所有品种均表现出弱的遗传结构，各个支系渗透到不同的品种中。安义瓦灰鸡没有进行大规模的选育，所以保持较高的单倍型多样性和碱基多样性。