提高几何互补评分筛选效率在分子对接方法中的研究

分子对接是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量匹配而相互识别的过程。分子对接在药物设计中具有十分重要的意义。由于分子间结合的构象数太大，怎样快速缩小构象搜索空间又能保证得到正确的对接结构是分子对接方法的关键问题。本立项通过搭建一个分子对接平台，将开发新的算法，整合一些成熟的技术。我们通过一种分级式自适应的新手段来真实模拟分子表面构建其三角化网格，通过多元素几何参数同时定义分子表面的几何特征区域，同时结合Voronoi-Delaunay类非结构网格建立一套准确高效的几何互补评分体系，并具有通用性，能用于需要几何评分的其他计算模拟系统中。