绵羊Y染色体微卫星DNA标记遗传特征与父系起源研究

基本信息
批准号:31072019
项目类别:面上项目
资助金额:34.00
负责人:罗玉柱
学科分类:
依托单位:甘肃农业大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:成述儒,马小军,胡江,方素栎,王继卿,张丽,李少斌,曹健,吴应童
关键词:
父系起源微卫星DNA绵羊Y染色体
结项摘要

绵羊起源研究多集中于具有母系遗传特点的线粒体DNA,这忽略了起源驯化中父本参与的进化事件。通过Y染色体DNA序列分析,寻找Y染色体潜在微卫星座位,检测确定有效微卫星座位;通过有效微卫星座位等位基因检测和数据分析,探索中国绵羊品种的父系起源;通过遗传多样性、系统发育和主成分分析及遗传结构估测,评价中国绵羊品种(或类群)的遗传多样性和Y染色体微卫星DNA标记特征。

项目摘要

为评价中国绵羊品种的遗传多样性及探讨绵羊的父系起源,本项目通过筛选Y染色体有效微卫星座位,分析中国绵羊品种微卫星座位群体遗传多态性及系统发育,获得了以下重要结果和结论,项目达到了预期目标。.1. 绵羊Y染色体共鉴定一个微卫星座位SRYM18,在11个绵羊品种共180个公羊样本中发现3个等位基因,片段大小分别为145bp、143bp和139bp。测序鉴定SRY18是复合型微卫星座位,包括Indel-/G碱基缺失、(TTTTG)m和(TG)m重复序列。.2. 绵羊AMEL基因能够被用于鉴定X和Y染色体,测序发现性别决定基因SRY启动子扩增区域存在A/G突变,呈现为2种SSCP带型。.3. 甘肃高山细毛羊遗传多样性比较丰富。甘肃高山细毛羊在13个微卫星座位共检测到111个等位基因,平均等位基因数为8.54;13个微卫星座位平均杂合子数为86.15;13个微卫星座位平均观察杂合度和平均期望杂合度分别为0.743和0.727;13个微卫星座位的平均PIC值为0.689。.4. DRB1-INTRO2座位对父权排除率贡献最大。甘肃高山细毛羊不同微卫星座位总数的父权排除率CPE分别为0.99985(11个微卫星座位)、0.999 912(12个微卫星座位)和0.99994(13个微卫星座位)。.5. 5个绵羊群体在5个微卫星座位上共发现了78个等位基因;5个微卫星座位在每个群体的等位基因数不同,其中甘肃高山细毛羊肃南县群体最多(57个),依次为甘肃高山细毛羊天祝县群体(56个)、藏羊群体(53个)、小尾寒羊群体(51个)和滩羊群体(43个);多态信息含量PIC在甘肃高山细毛羊肃南县群体中最高,而滩羊和小尾寒羊较低;藏羊观察杂合度最高(0.6800),而滩羊中最低(0.4480);甘肃高山细毛羊肃南县群体期望杂合度最高(0.9014),而滩羊群体中最低(0.8202)。综上结果表明甘肃高山细毛羊肃南县群体和天祝县群体的遗传多样性较丰富,而滩羊和小尾寒羊的遗传多样性较低。同时,系统发育关系表明藏绵羊与甘肃高山细毛羊天祝县群体和肃南县群体亲缘关系较近,而滩羊与小尾寒羊的亲缘关系较近。.以上重要结果和结论部分揭示了绵羊Y染色体微卫星DNA标记的分子遗传特征,对进一步评价中国绵羊品种遗传多样性及探讨父系起源研究有重要的指导意义。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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