长非编码RNA lnc-ALVE1-AS1在抗病毒天然免疫中的作用机制研究

Long non-coding RNAs (lncRNAs) are noncoding transcripts longer than 200 nucleotides, which mainly function in the form of RNA involved in multi-level regulations, including epigenetic, transcriptional and post-transcriptional regulations. Studies have shown that endogenous retrovirus sequences are important sources of lncRNAs in the genome but their function and regulation mechanism are unclear. Recently, an antisense lncRNA (named lnc-ALVE1-AS1) produced by avian leukosis viruses subgroup E (ALVE1) has been identified in chicken. We hypothesize that this lncRNA may be involved in antiviral innate immunity. This study aims at: (1) identifying the full length sequences and expression pattern of lnc-ALVE1-AS1 by RACE and strand-specific RT-qPCR technology; (2) determining functions of lnc-ALVE1-AS1 in antiviral innate immunity by lentiviral overexpression and shRNA interference for lnc-ALVE1-AS1; (3) exploring the mechanisms of lnc-ALVE1-AS1 in antiviral innate immunity by RNA-pull down and RIP technology. The project is of important significance not only for illustrating functions of endogenous retrovirus but also for resistance breeding of animals.

长非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA分子，以RNA的形式参与多层次调控，包括表观遗传学调控、转录调控以及转录后调控等。研究表明，基因组中内源性反转录病毒也是lncRNA的重要来源，但对它们的功能及其作用机制尚不清楚。目前，我们筛选到一个禽内源性反转录病毒（ALVE1）产生的反义lncRNA（命名为lnc-ALVE1-AS1），推测可能与细胞抗病毒天然免疫有关。此研究旨在：（1）通过RACE、链特异性RT-qPCR等技术鉴定lnc-ALVE1-AS1的全长序列及表达规律；（2）通过慢病毒过表达和shRNA干扰技术确定其在抗病毒天然免疫中的作用；（3）通过RNA-pull down和RIP等技术探索lnc-ALVE1-AS1在抗病毒天然免疫中的作用机制。研究结果不仅对内源性反转录病毒功能研究具有重大意义，也对畜牧业的抗病育种具有重要意义。

长非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA分子，以RNA的形式参与多层次调控，包括表观遗传学调控、转录调控以及转录后调控等。研究表明，基因组中内源性反转录病毒也是lncRNA的重要来源，但对它们的功能及其作用机制尚不清楚。本研究选择禽内源性反转录病毒（ALVE1）产生的反义lncRNA（命名为lnc-ALVE1-AS1）作为研究对象，旨在：（1）通过RACE、链特异性RT-qPCR等技术鉴定lnc-ALVE1-AS1的全长序列及表达规律；（2）利用过表达和RNAi技术确定其在抗病毒天然免疫中的作用；（3）通过RNA-pull down等技术探索lnc-ALVE1-AS1在抗病毒天然免疫中的作用机制。研究发现内源性反转录病毒衍生的反义长非编码RNA lnc-ALVE1-AS1具有抑制禽类肿瘤病毒增殖的作用，其作用机制主要是通过与TLR3蛋白结合以激活细胞抗病毒天然免疫。我们的研究结果为阐明基因组中广泛存在的内源性反转录病毒序列在人和动物抗病毒先天性免疫防御中的作用提出新见解，为将来抗病毒治疗提供新策略，为研制新的抗鸡白血病病毒疫苗以及动物抗病育种提供新思路。