基于F2资源群体的皱纹盘鲍生长性状QTL定位研究

数量性状基因座（QTL）定位一直是遗传学和育种学研究的热点和前沿科学问题。皱纹盘鲍是我国重要的海水经济养殖品种之一，其生长相关性状的定位研究处于起步阶段，目前的初步定位得到了部分相关位点，但受限于作图群体和分析手段，定位分析的精确度有限。为进一步揭示生长性状的遗传机制，本项目拟采用荧光微卫星和SNP标记扫描皱纹盘鲍三代全同胞半同胞F2资源群体，构建其生长相关连锁群精确度较高的图谱，并结合生长数据进行定位分析。通过评估各个位点的效应，识别与性状相关的标记，为下一步克隆相关基因、转基因操作以及培育新品种提供操作位点和理论基础。为确保F2资源群体的成功制备，本项目拟尝试构建皱纹盘鲍多重微卫星PCR体系用于该群体构建过程中的亲权鉴定。本研究利用F2资源群体对皱纹盘鲍进行生长性状QTL定位是一种创新性尝试，有利于深入探索皱纹盘鲍的生长性状的遗传机制和作用原理。

皱纹盘鲍是我国重要的海水养殖品种之一。研究与生长性状相关的数量性状基因座（quantitative trait loci，QTL），用于辅助传统育种，是提高皱纹盘鲍产量的一个有效解决方案。本项目首先构建了皱纹盘鲍多重微卫星PCR体系，建立了一种非致死的皱纹盘鲍高纯度基因组DNA微创提取方法。并以此为技术手段，建立了包含8个家系的皱纹盘鲍三代全同胞半同胞F2资源群体。利用36个微卫星标记对作图群体（6个F0个体，12个F1个体和1200个F2个体）进行扫描分析，构建了皱纹盘鲍遗传连锁图谱中第5连锁群（LG5）和第6连锁群（LG6），两个连锁群的全长分别为150.83cM和101.71cM，位点间的平均间距分别为8.87cM和5.98cM。与本研究者利用两个F1代皱纹盘鲍家系构建的遗传连锁图谱相比，F2资源群体所构建的两个连锁群的长度分别提高了2.22倍和2.41倍。最后，结合F2资源群体的表型性状，对皱纹盘鲍的生长相关性状进行了QTL定位分析，得到了9个QTLs，其中4个QTLs达到连锁群显著水平（p<0.05），3个QTLs达到连锁群极显著水平（p<0.01），并分析了置信区间内各个QTL位点对该性状的作用方式和贡献率，找到与性状相关的标记，为下一步克隆相关基因、转基因操作以及培育新品种提供参考区间和理论基础。