云南宣威肺癌发病机制的基因组学综合性研究

云南省宣威肺癌具有死亡率高，死亡率地区差异显著，女性高发、以腺癌为主等特点。以往单一水平的研究虽然鉴定出了一些与宣威肺癌相关的基因或其它分子，但无法系统地揭示其发生的分子机制。基于肺癌发生是一个多基因参与、多阶段发展的复杂病理过程，只有系统、综合的研究才有可能阐明其发生机制。本项目拟同时采用array-CGH芯片、外显子组测序、DNA甲基化芯片、microRNA芯片和测序、基因表达谱芯片等技术在基因组、基因、基因表达、基因表达调控等水平对宣威肺癌进行基因组范围的综合性研究，试图鉴定出与宣威肺癌发生发展相关的基因组拷贝数变化（CNVs）、基因突变、DNA甲基化谱、microRNA表达谱、突变或新microRNA分子以及基因表达谱，筛选出新的宣威肺癌分子诊断标记物及治疗靶点，通过揭示这些不同水平改变之间的内在联系及相互作用，初步阐明宣威肺癌的发病途径和发病机制，为宣威肺癌的深入研究奠定基础。

云南省宣威肺癌是一种极具发病特点的肺癌，包括发病率高、死亡率高、女性高发、以腺癌为主等。以往的研究主要集中于流行病学研究，结果显示宣威肺癌发病与居民燃烧当地产的烟煤及室内通风不足密切相关。然后，当地政府实施的改炉改灶工程并未使宣威肺癌的发病率得到有效控制。宣威肺癌独特的发病是否预示着其在发病机制方面与其他地区的肺癌有所不同？这是一个值得研究的科学问题。然而以往国内外针对宣威肺癌发病机制的研究并不多，且主要是对一些已明确在肿瘤发生发展中发挥重要作用的基因在宣威肺癌中进行的验证性研究，难以有新发现和新突破。为了能全面而深入的对宣威肺癌的发病机制开展研究本项目预期同时在基因组、基因、基因表达及调控水平对宣威肺癌进行 “面”的筛查及整合分析，希望能筛选出宣威肺癌特征性的标志物。在既定期限内，本项目组基本按照预定的目标和进度实施项目。收集了近100例新鲜的宣威肺癌标本、100余例石蜡包埋的宣威肺癌标本及患者完整的临床信息，初步构建了宣威肺癌标本库。完成了10对样本的array-CGH芯片、基因表达谱芯片、microRNA芯片、DNA甲基化芯片的检测工作，以及2对样本的全基因组测序工作，通过对每个平台的检测结果及不同平台整合分析的结果进行生物信息分析和验证，初步筛选出了与宣威肺癌发生发展相关的基因组拷贝数变化（CNAs）、基因突变谱、DNA甲基化谱、microRNA表达谱以及基因表达谱，并构建了相应的数据库，对宣威肺癌基因组水平的改变有了一个初步的、较完整的认识，为宣威肺癌发病机制的进一步研究即开展的“点”研究奠定了良好的基础。到目前为止，在本项目的资助下，本项目组已发表了5篇中文论文，1篇SCI论文已被接受，1篇SCI论文正在审稿，另有3篇SCI论文在准备中；培养了宣威肺癌发病机制研究方面的硕士研究生3名，另有再读博士研究生1名，再读硕士研究生3名；以本项目为基础，本项目组成功申请到国家自然科学基金项目1项目，云南省省级重点项目1项，云南省卫计委内设研究机构项目1项，为本项目的后续研究奠定了良好的基础。