微小RNA甲基化和结直肠癌预后转归的关联分析和功能论证

基本信息
批准号:81001055
项目类别:青年科学基金项目
资助金额:19.00
负责人:蔡国响
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2010
结题年份:2013
起止时间:2011-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:徐烨,王晓艳,王蓓兰,肖长春,姜争,龚静,齐心,宋宝荣
关键词:
微小RNA甲基化预后结直肠癌
结项摘要

寻找新的预后相关分子生物学指标是肿瘤学研究热点。微小RNA(miRNA)是基因调控的重要机制,和肿瘤发生发展关系密切。CpG岛甲基化是miRNA表达的调控机制之一。申请者前期甲基化芯片研究提示miRNA-10a、miRNA-615等三种miRNA的高甲基化和结直肠癌的复发转移密切相关,目前文献上还未见相关报道。本课题拟在甲基化芯片筛选的基础上,在扩大的独立的结直肠癌组织样本上验证候选的miRNA甲基化是否具有预后判断的临床价值。同时在结直肠癌细胞株和组织标本上,从miRNA表达的调控、细胞株转移潜能的影响、靶标mRNA和靶标代谢物四个方面,研究候选miRNA甲基化的生物学功能。本课题首次对miRNA甲基化和结直肠癌预后的关系进行了深入的研究,可能发现具有预后判断价值的新的分子标志物,有助于提高预后判断的准确性,指导患者的个体化治疗,也有助于了解miRNA甲基化在结直癌复发转移中的作用机制。

项目摘要

项目对结直肠癌预后相关微小RNA(miRNA)、CpG岛甲基子表型(CIMP)、长链非编码RNA(lncRNA)和代谢物进行研究。(1)miR-615:在结肠癌细胞株证实去甲基化干预上调miR-615-3p表达1.5倍以上(p值均<0.01)。miR-615-3p过表达干预显著抑制结肠癌细胞增殖、迁移和侵袭能力。对46例结直肠癌及其配对正常大肠粘膜组织进行miR-615甲基化和表达检测,显示miR-615在癌组织中甲基化阳性率显著高于正常组织(p<0.01),癌组织甲基化和表达呈显著负相关(p<0.05)。对85例接受根治性手术II/III期结直肠癌组织标本进行miR-615甲基化检测,显示miR-615甲基化阳性患者3年无疾病生存(DFS)显著低于阴性组(p<0.01)。(2)候选miR-X(由于涉及合作研究,结果尚未正式发表,故作保密处理):对77例II/III期结直肠癌组织进行miR-X表达检测,显示术后3年内复发转移组miR-X的表达显著高于无复发转移组(p<0.01)。生物信息学分析显示miR-X可能靶向调控精氨酸代谢关键酶ADC。对RKO细胞株进行miR-X过表达干预后,发现ADC mRNA水平下调,精氨酸水平显著上升。提示ADC和精氨酸可能是miR-X的靶标基因和代谢产物。(3)miR-10a:甲基化分析显示19例I期结直肠癌的miR-10a甲基化阳性率显著高于配对的正常粘膜上皮(p<0.01)。(4) CpG岛甲基子表型(CIMP):对 50例Ⅱ/Ⅲ期结直肠癌进行5个基因甲基化检测,确定CIMP。分析表明CIMP是影响患者5年DFS的因素(P=0.014)。(5)lncRNA-MALAT1:对 146例Ⅱ/Ⅲ期结直肠癌进行MALAT1基因表达检测。结果显示MALAT1相对高表达者的DFS和总生存(OS)均显著低于MALAT1低表达者(p值均<0.01)。(6)代谢组学研究:采用GC-TOFMS对79例Ⅰ-Ⅲ期结直肠癌组织进行代谢组学检测,发现了由15个代谢物组成的代谢谱能够较好地预测患者预后,预测5年总生存(OS)的敏感性为0.938,特异性为0.746。课题组已发表SCI论文16篇,其中标注本基金资助SCI论文3篇,最高影响因子7.837,2篇课题负责人为通讯作者,1篇为第二作者。协助培养研究生7名,已毕业5名。其中2篇毕业论文标注了本基金资助。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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