靶向测序搜寻染色体20q13.33区域内特应性皮炎易感基因

基本信息
批准号:31171224
项目类别:面上项目
资助金额:60.00
负责人:孙良丹
学科分类:
依托单位:安徽医科大学
批准年份:2011
结题年份:2015
起止时间:2012-01-01 - 2015-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:左先波,程晖,张峥,汤华阳,李平,曾明,丁延涛
关键词:
易感基因测序20q1333特应性皮炎全基因组关联研究
结项摘要

特应性皮炎(AD)是一种常见好发于儿童的免疫相关性多基因遗传疾病。该病发病机制尚不明确,缺乏有效根治手段,严重影响儿童身心健康。本研究小组前期通过全基因组关联研究,利用多中心,多民族(中国:18,195例;德国:5,062例)搜寻AD易感基因,发现AD新的易感位点20q13.33,达到全基因组关联显著水平(P=3×10-8)。本研究拟利用新一代靶向捕获序列技术结合大规模平行测序对目标区域20q13.33进行深度测序,搜寻AD发病直接相关遗传变异;利用RT-PCR,Western-Blot、报告基因实验等方法对其进行功能研究,揭示AD发病机制;针对发现的易感基因建立GWAS研究队列,探讨AD遗传流行病学规律,揭示疾病发生、发展过程。本研究将为发现AD易感人群、遗传靶标,风险预测,临床诊断治疗及新药研发提供新的理论依据。

项目摘要

特应性皮炎(AD)是一种常见好发于儿童的免疫相关性多基因遗传疾病。该病发病机制尚不明确,缺乏有效根治手段,严重影响儿童身心健康。为了更深入发掘AD病因,我们在前期全基因组关联分析(GWAS)数据的基础上对前期发现的AD易感位点20q13进行深入研究,搜寻疾病相关变异,确认AD的真正易感基因,构建AD基因型-表型数据库,为将来AD发病风险评估及基因诊疗奠定基础。本项目开展了AD与哮喘的共同易感基因研究、AD精细定位研究、AD基因型-表型研究等。.研究发现14q11.2之上的rs4982958与哮喘显著性相关。另外研究发现5q22.1区域内的GGGA单倍型与AD显著性相关,同时与哮喘的相关性具有提示意义,该研究证实14q11.2是哮喘的一个重要信号区域,而5q22.1是AD和哮喘共有的易感信号区域。为了进一步坚定AD的风险变异和确定新的易感区域,我们联合欧美研究团队对2425个德国患者和5449对照进行了精细定位,随后在来自德国,爱尔兰,日本和中国范围内的7196患者和15480对照进行了验证。鉴别出4个新的AD易感位点:rs17389644,rs12295535,rs2041733和rs16948048分别位于4q27,11p13,16p13.13和17q21.32区域内,验证出亚洲AD人群2个易感基因位点,这些新发现的疾病易感位点/基因不仅可以解释5.4%疾病的遗传易感性,而且揭示了AD与其他免疫相关疾病可能具有共同的易感位点和发病机制,同时丰富了AD的遗传学分子机制,积极推进了AD发病机制和病因研究;基因型-表型分析研究发现rs2393903和rs6010620的SNP与临床特征分型密切相关,该研究不仅说明AD是一种异质性很强的疾病,而且证实了10q21.2, 20q13.33区域与不合并哮喘AD和散发AD发病呈现正相关,证明了这两个位点可能分别针对不同的亚型呈现特定的相关性;同时基因型-表型分析研究发现AD的易感基因FLG的c.3321delA突变与AD多个临床表型相关,包括皮肤干燥、掌纹增多、白色划痕症等表型,该研究成果揭示了c.3321delA突变不但与中国汉族人AD疾病本身相关,而且参与某些临床表型的发生。.上述研究成果为AD发病机制研究及成果临床转化进程提供新的理论依据,对于提升我国遗传学研究领域的综合实力和创立疾病基因自主知识产权具有重要意义。

项目成果
{{index+1}}

{{i.achievement_title}}

{{i.achievement_title}}

DOI:{{i.doi}}
发表时间:{{i.publish_year}}

暂无此项成果

数据更新时间:2023-05-31

其他相关文献

1

玉米叶向值的全基因组关联分析

玉米叶向值的全基因组关联分析

DOI:
发表时间:
2

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DeoR家族转录因子PsrB调控黏质沙雷氏菌合成灵菌红素

DOI:10.3969/j.issn.1673-1689.2021.10.004
发表时间:2021
3

卫生系统韧性研究概况及其展望

卫生系统韧性研究概况及其展望

DOI:10.16506/j.1009-6639.2018.11.016
发表时间:2018
4

青藏高原狮泉河-拉果错-永珠-嘉黎蛇绿混杂岩带时空结构与构造演化

青藏高原狮泉河-拉果错-永珠-嘉黎蛇绿混杂岩带时空结构与构造演化

DOI:10.3799/dqkx.2020.083
发表时间:2020
5

基于分形维数和支持向量机的串联电弧故障诊断方法

基于分形维数和支持向量机的串联电弧故障诊断方法

DOI:
发表时间:2016

孙良丹的其他基金

批准号:30800990
批准年份:2008
资助金额:20.00
项目类别:青年科学基金项目
批准号:81072461
批准年份:2010
资助金额:36.00
项目类别:面上项目
批准号:81573035
批准年份:2015
资助金额:50.00
项目类别:面上项目
批准号:81773313
批准年份:2017
资助金额:60.00
项目类别:面上项目

相似国自然基金

1

全基因组搜寻特应性皮炎的易感基因

批准号:81071284
批准年份:2010
负责人:肖风丽
学科分类:H12
资助金额:36.00
项目类别:面上项目
2

5q22.1区域搜寻特应性皮炎易感基因研究

批准号:81172838
批准年份:2011
负责人:肖风丽
学科分类:H1106
资助金额:55.00
项目类别:面上项目
3

中国汉族人特应性皮炎易感基因FLG的精细定位与功能研究

批准号:81602744
批准年份:2016
负责人:孟丽
学科分类:H12
资助金额:17.00
项目类别:青年科学基金项目
4

9号染色体中国汉族人银屑病易感基因搜寻

批准号:30771942
批准年份:2007
负责人:杨森
学科分类:H1202
资助金额:29.00
项目类别:面上项目