基于LC-MS技术的CTCL生物标志物的发现及其生物学意义研究

基本信息
批准号:81272988
项目类别:面上项目
资助金额:16.00
负责人:郁韵秋
学科分类:
依托单位:复旦大学
批准年份:2012
结题年份:2013
起止时间:2013-01-01 - 2013-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:施若非,朱孔黎,刘晓云,王悦琳,董琦鑫
关键词:
早期诊断液质联用代谢组学生物标志物皮肤T细胞淋巴瘤
结项摘要

Our previous study has found that there are significant differences between patients metabolomes of cutanous T cell lymphoma(CTCL) with normal person. Therefore,this project plans to use metabolomics research concept, LC-MS as the technology platform, to investigate the specific markers in the plasma(or serum )of patients with CTCL. The purpose of this project will be drawing metabolic profiling, establish CTCL early diagnosis model. Furthermore, model of patients with different immunological phenotype and prognosis will be constructed. The results will not only provide evidence for the early diagnosis of CTCL, but also distinguish clinical pheno type of CTCL. Due to metabolomics and genomics, transcriptomics and proteomics are "omics" technology, they are not only self-contained but also closely related, as a comprehesive system. The result of independent "omics" studies is less integrated. Considering this point, we will also focus on the correlation between metabonomics and our previous results of microRNA (transcriptomics). Combined with clinical data, verification and correction model, we will have a more clear and comprehensive understanding of the pathogenesis of the disease.

我们前期的研究已经发现T细胞淋巴瘤(cutanous T cell lymphoma, CTCL)患者的代谢组与正常人之间存在着显著性差异。因此,本项目拟运用代谢组学的研究理念,以LC-MS为技术平台,以CTCL患者血浆/清为研究对象,寻找CTCL特异性标志物,目的是绘制其代谢轮廓,建立其早期诊断模型;进一步构建不同免疫表型和预后的区分模型。研究的成果将为CTCL的早期诊断提供证据,并有利于对CTCL的分型和预后的判断。由于代谢组学与基因组学,转录组学和蛋白质组学均属于"组学"技术,它们既自成体系又密切联系,是一个完整的系统。独立组学的研究关注于某个局部体系,容易以偏概全,因此本项目还将尝试组学间的关联研究,把代谢组学研究的数据与我们前期研究的microRNA结果(属转录组学)作比对,以期获得信息之间的呼应和关联,结合临床数据和特点,验证和修正模型,从而获得对疾病更为清晰和全面的认识。

项目摘要

【研究意义】皮肤T细胞淋巴瘤(cutaneous T cell lymphoma, CTCL)是一原发于皮肤的恶性T细胞性肿瘤,是最常见的T细胞的恶性病变之一,而且目前仍缺乏特征的、非创伤性的技术来进行早期诊断,而早期诊断无论对患者还是临床医师都意义重大。因此,寻找CTCL的生物标记物,通过测定体液(血液、尿液等)这些简便、非创伤性的检测手段来进行早期诊断,是临床上迫切需要解决的问题。【研究技术和对象】本项目运用代谢组学的理念,采用UHPLC-QTOF/MS(超高压液相色谱-质谱联用技术),以CTCL患者血浆为研究对象,为发现CTCL的生物标志物展开研究。【研究目标】寻找CTCL 血浆中的特异性生物标志物,绘制其代谢轮廓,为建立早期诊断模型提供依据。【完成情况】本项目依照研究目标和时间,完成项目计划书中所列的各项任务,内容涉及:CTCL患者的样本收集;色谱条件选择和优化以及方法学验证;考察数据采集和分析过程中的各种影响因素;数据采集和分析;生物标志物的发现和研究。【研究成果】通过此项研究,得到CTCL患者和正常人两组间差异化较大的化合物列表(超过600个化合物,P>0.05);筛选出36个化合物为潜在生物标志物;其中已有4个得到验证和确认;研究结果还表明这些代谢物主要是磷脂胆碱类和氨基酸类物质。以上工作的归纳和总结已经撰写研究论文1篇,题目为“Metabolomic investigation of CTCL based on UHPLC-QTOF/MS”,投稿杂志为:CLINICAL BIOCHEMISTRY。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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