新型组合多孔材料方法及其在结肠癌质谱检测分析中的应用

基本信息
批准号:81771983
项目类别:面上项目
资助金额:55.00
负责人:钱昆
学科分类:
依托单位:上海交通大学
批准年份:2017
结题年份:2021
起止时间:2018-01-01 - 2021-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:许瑾,顾翔,Chandrababu Rejeeth,Vadanasundari Vedarethinam,Deepanjali D. Gurav,黄琳,孙旭明,徐伟,郭凯
关键词:
样品处理分子标志物质谱分析多孔材料生物技术
结项摘要

The detection efficacy can be highly enhanced using nanoporous materials during bio-molecular profiling by mass spectrometry. Nanoporous materials with specific pore size can selectively extract bio-molecules due to the size-selective effect, where designed surface chemistry is essential to provide the desirable driving force. However, there are very few reports on the extraction and detection of bio-molecules using a combination of different materials and most current strategies are focused on the application of a single type of nanoporous materials. Consequently, only parts of bio-molecules can be profiled and the whole bio-system is not well understood. In this project, we aim to build a platform technology based on novel nanoporous materials and their combinations, superior to conventional methods and commercial products. The combo-pore technology can enable advanced profiling towards diverse proteins/peptides and investigate the post-translational modifications of these molecules in a programmable manner. There are three main aspects to be included in this project: 1) functional macroporous materials (pore size around 100 nm) for proteins proteolysis and identification in proteomic study; 2) functional mesoporous materials (pore size less than 10 nm) for peptides extraction and detection in peptidomic study; 3) combinations of macro-/meso-porous materials with designed surface chemistry towards disease biomarkers screening and comprehensive bio-molecular profiling in colon cancer bio-samples.

具有不同孔径尺寸、表面化学的多孔材料能够根据孔道与客体生物分子的尺寸匹配效应,以功能化设计的表面相互作用为驱动力,选择性地从生物样品中提取分析相应的分子组,有效提高分子质谱检测鉴定效率。然而,现阶段组合多孔材料的方法模型极少,研究通常使用单一结构/功能的多孔材料提取分析特定类别的蛋白质/多肽分子,不利于获取生物样品的完整信息,在实际应用中极为受限。本项目拟在生物系统的分子组成分析中引入新型组合多孔材料方法,即按照一定的顺序组合使用不同孔径、表面化学的多孔材料,程序化分析待测样品的蛋白质组和多肽组,筛查蛋白质/多肽分子标志物及其后翻译修饰作用,其主要包含以下三方面内容:一)功能化有序大孔材料(孔径约为100 nm)及其在蛋白质组检测分析中的应用;二)功能化有序介孔材料(孔径小于10 nm)及其在多肽组检测分析中的应用;三)组合使用以上大孔、介孔材料用于检测分析实际结肠癌生物样品的分子组成。

项目摘要

具有不同孔径尺寸、表面化学的多孔材料能够根据孔道与客体生物分子的尺寸匹配效应,以功能化设计的表面相互作用为驱动力,选择性地从生物样品中提取分析相应的分子组,有效提高分子质谱检测鉴定效率。然而,现阶段组合多孔材料的方法模型极少,研究通常使用单一结构/功能的多孔材料提取分析特定类别的蛋白质/多肽分子,不利于获取生物样品的完整信息,在实际应用中极为受限。本项目拟在生物系统的分子组成分析中引入新型组合多孔材料方法,即按照一定的顺序组合使用不同孔径、表面化学的多孔材料,程序化分析待测样品的蛋白质组和多肽组,筛查蛋白质/多肽分子标志物及其后翻译修饰作用,其主要包含以下三方面内容:一)功能化有序大孔材料(孔径约为100 nm)及其在蛋白质组检测分析中的应用;二)功能化有序介孔材料(孔径小于10 nm)及其在多肽组检测分析中的应用;三)组合使用以上大孔、介孔材料用于检测分析实际结肠癌生物样品的分子组成。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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