细菌sRNA预测研究

细菌sRNA是一类长度在40～500nt之间的小非编码RNA，通过与靶mRNA结合对靶基因表达进行转录后调控或与靶蛋白结合调控靶蛋白的活性，在细菌致病性、细菌膜蛋白表达和铁离子利用等方面发挥重要的调控作用。然而，在目前已测序的1000多个微生物基因组中，仅对常见的大肠杆菌、沙门氏菌和金葡菌等少数细菌基因组中的sRNA进行了发现与初步的功能研究，还有大量的sRNA等待发现。本项目拟运用RNA二级结构预测等生物信息学方法和模式识别等统计学方法对细菌sRNA转录起点、sRNA本身和sRNA转录终点区域开展序列与结构特征分析，并构建通用的sRNA预测模型，最终为实验发现新的细菌sRNA提供生物信息学支持，也为其它物种的非编码RNA预测研究提供一定参考。

细菌sRNA是一类长度在40～500nt之间的小非编码RNA，通过与靶mRNA结合对靶基因表达进行转录后调控或与靶蛋白结合调控靶蛋白的活性，在细菌致病性、细菌膜蛋白表达和铁离子利用等方面发挥重要的调控作用。因此，开发细菌sRNA的预测模型具有重要意义。为此，我们综合运用模式识别等统计学方法对细菌sRNA转录起点和sRNA转录终点区域开展序列与结构特征分析，并构建了通用sRNA预测模型，最终为实验发现新的细菌sRNA提供生物信息学支持，也为其它物种的非编码RNA预测研究提供一定参考。