miRNA是植物基因组中广泛存在,且长度为21个核苷酸左右的内源性非编码调控RNA,主要通过指导靶基因的切割或降低靶基因的翻译来抑制植物基因的表达。本项目利用前期工作所获得的番茄果实大规模深度测序数据,用生物信息学的方法分析番茄果实成熟过程(未熟期、粉红期、破色期)中小片段RNA序列,鉴别出已知存在的miRNA以及预测新的miRNA,并进行功能分析和实验验证;同时研究所鉴定出miRNA在番茄果实三个不同成熟阶段的表达变化,以及乙烯、1-MCP处理后这些miRNA的表达变化,分析番茄果实中miRNA表达与成熟度、乙烯的相关性,确定与番茄果实成熟衰老、 乙烯作用相关的miRNA,为最终阐明miRNAs调控果蔬成熟衰老的机理打下基础。
番茄是研究果实成熟的模式材料,番茄果实的成熟过程是一个高度协调的遗传调控过程。miRNAs是一种新发现的转录后调控因子,在许多植物的生理生化过程中起着重要的调控作用。本研究利用深度测序技术,采用生物信息学和分子生物学实验相结合的方法,分离鉴定出了与果实成熟和乙烯相关的miRNAs,并对其靶基因进行了预测和系统的功能分析,为阐明miRNAs参与调控果实的成熟衰老及乙烯途径提供了一定的理论基础。
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数据更新时间:2023-05-31
A Prehepatectomy Circulating Exosomal microRNA Signature Predicts the Prognosis and Adjuvant Chemotherapeutic Benefits in Colorectal Liver Metastasis
基于公众情感倾向的主题公园评价研究——以哈尔滨市伏尔加庄园为例
MicroRNAs in Transforming Growth Factor-Beta Signaling Pathway Associated With Fibrosis Involving Different Systems of the Human Body
三级硅基填料的构筑及其对牙科复合树脂性能的影响
采用深度学习的铣刀磨损状态预测模型
番茄果实中成熟相关转录因子的分离和功能分析
基于VIGS的番茄成熟衰老、乙烯相关的NAC转录因子的分离与功能分析
番茄果实成熟相关外显子环化RNA(circRNA)的鉴定和初步功能分析
番茄果实中乙烯相关circRNAs的分离及其与miRNAs的协同调控功能研究