番茄果实中成熟、乙烯相关miRNA的分离、鉴定与功能分析

基本信息
批准号:30972037
项目类别:面上项目
资助金额:30.00
负责人:朱本忠
学科分类:
依托单位:中国农业大学
批准年份:2009
结题年份:2012
起止时间:2010-01-01 - 2012-12-31
项目状态: 已结题
项目参与者:李欣,燕国梁,卢丞文,李玲,马远征,迟丽红
关键词:
深度测序乙烯成熟miRNA番茄果实
结项摘要

miRNA是植物基因组中广泛存在,且长度为21个核苷酸左右的内源性非编码调控RNA,主要通过指导靶基因的切割或降低靶基因的翻译来抑制植物基因的表达。本项目利用前期工作所获得的番茄果实大规模深度测序数据,用生物信息学的方法分析番茄果实成熟过程(未熟期、粉红期、破色期)中小片段RNA序列,鉴别出已知存在的miRNA以及预测新的miRNA,并进行功能分析和实验验证;同时研究所鉴定出miRNA在番茄果实三个不同成熟阶段的表达变化,以及乙烯、1-MCP处理后这些miRNA的表达变化,分析番茄果实中miRNA表达与成熟度、乙烯的相关性,确定与番茄果实成熟衰老、 乙烯作用相关的miRNA,为最终阐明miRNAs调控果蔬成熟衰老的机理打下基础。

项目摘要

番茄是研究果实成熟的模式材料,番茄果实的成熟过程是一个高度协调的遗传调控过程。miRNAs是一种新发现的转录后调控因子,在许多植物的生理生化过程中起着重要的调控作用。本研究利用深度测序技术,采用生物信息学和分子生物学实验相结合的方法,分离鉴定出了与果实成熟和乙烯相关的miRNAs,并对其靶基因进行了预测和系统的功能分析,为阐明miRNAs参与调控果实的成熟衰老及乙烯途径提供了一定的理论基础。

项目成果
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数据更新时间:2023-05-31

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