野生稻小穗矮秆基因spd6的克隆与功能鉴定

目前我们已把来自野生稻的小穗矮秆基因spd6定位在第6染色体上的22.4 kb范围内，该区段内有4个有注释的基因。我们对这4个候选基因的3个基因进行转基因功能验证,结果表明其中的一个候选基因就是SPD6。SPD6编码一个推定的亮氨酸甲基羧基转移酶-1（LCMF-1）。野生稻的该基因位点为隐性，表型观察结果表明spd6基因具有一因多效性，对多个性状包括穗数、谷粒大小、穗粒数和株高均有作用，显示该基因在水稻产量形成过程中可能起到重要作用。前人的研究表明在动物体内该酶可以对蛋白磷酸酶PP2A的催化亚基C的C-端的亮氨酸残基进行甲基化。而在植物中该基因的功能还未见报道。本项目拟在原有研究基础上，运用遗传学和分子生物学研究方法深入分析水稻SPD6的功能和作用机理，寻找互作因子，建立SPD6参与调控产量性状的遗传途径，分析其育种应用价值，为作物高产分子育种提供新基因。

我们通过转基互补实验证实LCMF1基因（LOC_Os06g04820）基因就是我们要克隆的SPD6基因。但是在野生稻中很难得到该基因的全长基因组DNA序列。为了弄清楚spd6表型产生的机理，我们通过tail pcr和5'race技术获得了野生稻中该基因的序列变化信息，一个3256bp的缺失可以解释spd6表型产生的原因，而且该缺失使LOC_Os06g04820和LOC_Os06g04830两个基因组合成一个新的基因，而且该基因具有生物功能与否未知。